More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_33078 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_33078  putative xylose transporter  100 
 
 
495 aa  1006    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.442314 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02020  hexose transport-related protein, putative  33.41 
 
 
535 aa  229  7e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50413  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02614  plasma membrane hexose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00220)  32.35 
 
 
528 aa  227  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.969205  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29041  hexose transporter (tentative)  30.89 
 
 
493 aa  223  8e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.773835  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00233  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14500)  30.71 
 
 
503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35662  hexose transporter  30.79 
 
 
551 aa  217  4e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.908779  normal  0.396773 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08889  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00220)  28.45 
 
 
501 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.431499 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08112  hexose transporter protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04480)  28.88 
 
 
511 aa  213  9e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251186  normal  0.370346 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54022  probable hexose transporter  30.12 
 
 
500 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80517  probable hexose transporter  28.86 
 
 
547 aa  207  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.663826  decreased coverage  0.00990002 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03990  hexose transporter protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04480)  29.66 
 
 
524 aa  207  5e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131419  normal 
 
 
-
 
NC_006683  CNN02090  hexose transport-related protein, putative  28.6 
 
 
545 aa  204  2e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38981  Predicted transporter (major facilitator superfamily)  29.46 
 
 
540 aa  203  5e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0971418 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31830  hexose transporter  28.47 
 
 
534 aa  200  6e-50  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.23109  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05180  hexose transport-related protein, putative  28.73 
 
 
519 aa  199  7.999999999999999e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.900345  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_11314  possible hexose transporter  28.82 
 
 
476 aa  197  3e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.96677  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07088  hexose transporter protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04480)  29.79 
 
 
471 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  28.84 
 
 
495 aa  187  5e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03199  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14540)  26.32 
 
 
576 aa  183  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  27.39 
 
 
536 aa  181  4e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30035  Lactose permease  28.36 
 
 
554 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29297  Lactose Permease  25.95 
 
 
555 aa  176  6e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.335597  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00370  hexose transport-related protein, putative  26.65 
 
 
547 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09169  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  25.75 
 
 
510 aa  171  3e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0950433  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01577  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01860)  26.09 
 
 
539 aa  170  5e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0938602 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08347  conserved hypothetical protein  31.63 
 
 
470 aa  170  6e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57768  putative lactose permease  27.53 
 
 
499 aa  167  4e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 
512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02814  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17310)  25.87 
 
 
553 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0410012  normal  0.438044 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  29.82 
 
 
544 aa  164  3e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06831  conserved hypothetical protein  25 
 
 
536 aa  163  6e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04240  hexose transport-related protein, putative  25.91 
 
 
516 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02110  monosaccharide transporter, putative  26.33 
 
 
514 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  24.34 
 
 
579 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04630  conserved hypothetical protein  26.99 
 
 
499 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02584  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01180)  26.52 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  25.54 
 
 
551 aa  148  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08464  conserved hypothetical protein  26.71 
 
 
461 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566054 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  23.05 
 
 
531 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  26.73 
 
 
524 aa  144  4e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  22.31 
 
 
561 aa  143  8e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02544  conserved hypothetical protein  23.99 
 
 
552 aa  142  9.999999999999999e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02100  monosaccharide transporter, putative  24.73 
 
 
510 aa  142  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  24.19 
 
 
561 aa  141  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  25.93 
 
 
499 aa  141  3e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_40173  Sugar transporter  25.88 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08467  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11050)  25.95 
 
 
532 aa  140  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  0.181108 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09184  conserved hypothetical protein  23.92 
 
 
531 aa  139  7.999999999999999e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00120  sugar transporter, putative  24.8 
 
 
539 aa  138  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.891292  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  23.94 
 
 
548 aa  137  3.0000000000000003e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_27984  Sugar UpTake (tentative)  25.54 
 
 
550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_27983  Sugar UpTake (tentative)  25.54 
 
 
550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.180127  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64741  sugar transporter protein  25.97 
 
 
550 aa  136  8e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.402333  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  23.97 
 
 
529 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  23.72 
 
 
533 aa  135  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05067  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G02840)  25.35 
 
 
531 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140503  hitchhiker  0.0000138445 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03105  MFS sugar transporter protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12580)  23.09 
 
 
535 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  23.06 
 
 
590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02958  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06720)  24.58 
 
 
520 aa  133  9e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.280694 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66414  hexose transporter  24.73 
 
 
553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.730098  normal  0.0488082 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1363  sugar transporter family protein  25.56 
 
 
473 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498359  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  25.88 
 
 
534 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1174  sugar transporter  25.11 
 
 
473 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  24.37 
 
 
591 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02665  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02010)  24.4 
 
 
541 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 
743 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  24.94 
 
 
504 aa  128  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  24.34 
 
 
576 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47769  predicted protein  25.16 
 
 
522 aa  127  6e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0468  sugar transporter  22.85 
 
 
447 aa  126  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02475  Putative sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870E7]  24.38 
 
 
490 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0479  sugar transporter  26.02 
 
 
471 aa  124  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749242  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09173  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00890)  25.64 
 
 
500 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02570  receptor, putative  25.55 
 
 
529 aa  124  3e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.76404  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  24.85 
 
 
519 aa  124  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  26.52 
 
 
480 aa  124  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01940  monosaccharide transporter, putative  24.5 
 
 
599 aa  124  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08084  conserved hypothetical protein  25.06 
 
 
430 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  26.58 
 
 
542 aa  121  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  24.03 
 
 
561 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_16856  high affinity xylose transporter (putative) (HGT3)  26.44 
 
 
529 aa  121  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0752816  normal  0.401981 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  21.77 
 
 
595 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  23.79 
 
 
527 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02680  glucose transporter, putative  24.08 
 
 
552 aa  120  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9947  predicted protein  24.83 
 
 
439 aa  119  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  25.42 
 
 
545 aa  119  9e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02420  receptor, putative  25.05 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.915792  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02974  conserved hypothetical protein  25.83 
 
 
477 aa  117  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  22.2 
 
 
543 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01865  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04550)  24.89 
 
 
490 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.57 
 
 
477 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36948  high-affinity hexose (glucose) transporter  24.9 
 
 
525 aa  117  6e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.046165  normal  0.598705 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1952  sugar transporter  25.84 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2486  sugar transporter  25.99 
 
 
509 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.625827 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03836  conserved hypothetical protein  25.32 
 
 
547 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  22.95 
 
 
550 aa  115  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02910  hexose transport-related protein, putative  24.48 
 
 
545 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91253  glucose transporter/sensor  24.63 
 
 
528 aa  114  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  23.11 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  23.11 
 
 
464 aa  113  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>