More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30035 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_30035  Lactose permease  100 
 
 
554 aa  1142    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29297  Lactose Permease  40 
 
 
555 aa  380  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.335597  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57768  putative lactose permease  39.83 
 
 
499 aa  349  9e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03199  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G14540)  35.5 
 
 
576 aa  327  3e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.163159 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01577  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G01860)  33.88 
 
 
539 aa  277  3e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0938602 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06831  conserved hypothetical protein  32.64 
 
 
536 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.272941  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02814  MFS lactose permease, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17310)  31.92 
 
 
553 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0410012  normal  0.438044 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00370  hexose transport-related protein, putative  31.37 
 
 
547 aa  239  9e-62  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02020  hexose transport-related protein, putative  30.58 
 
 
535 aa  229  1e-58  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50413  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02614  plasma membrane hexose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00220)  29.31 
 
 
528 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.969205  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08112  hexose transporter protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04480)  29.5 
 
 
511 aa  206  7e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.251186  normal  0.370346 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05180  hexose transport-related protein, putative  29.23 
 
 
519 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.900345  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02090  hexose transport-related protein, putative  27.49 
 
 
545 aa  191  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08889  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00220)  30.19 
 
 
501 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.431499 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80517  probable hexose transporter  27.8 
 
 
547 aa  188  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.663826  decreased coverage  0.00990002 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03105  MFS sugar transporter protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12580)  27.72 
 
 
535 aa  183  7e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04240  hexose transport-related protein, putative  27.53 
 
 
516 aa  180  8e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33078  putative xylose transporter  28.36 
 
 
495 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.442314 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05050  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12170)  26.95 
 
 
495 aa  170  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00148453  hitchhiker  0.00000000414532 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03990  hexose transporter protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04480)  25.89 
 
 
524 aa  168  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.131419  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29041  hexose transporter (tentative)  28.23 
 
 
493 aa  166  6.9999999999999995e-40  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.773835  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54022  probable hexose transporter  27.79 
 
 
500 aa  166  1.0000000000000001e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08347  conserved hypothetical protein  28.57 
 
 
470 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_38981  Predicted transporter (major facilitator superfamily)  25.39 
 
 
540 aa  163  9e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0971418 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07088  hexose transporter protein (AFU_orthologue; AFUA_8G04480)  27.82 
 
 
471 aa  162  1e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35662  hexose transporter  25.83 
 
 
551 aa  159  1e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.908779  normal  0.396773 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04148  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13080)  29.05 
 
 
548 aa  156  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.900838  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00020  glucose transporter, putative  26.71 
 
 
519 aa  156  8e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31830  hexose transporter  26.4 
 
 
534 aa  155  1e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.23109  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03580  hexose transport-related protein, putative  25.85 
 
 
595 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00233  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14500)  26.42 
 
 
503 aa  154  4e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.337933 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02730  hexose transport-related protein, putative  25.48 
 
 
590 aa  152  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02665  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G02010)  26.27 
 
 
541 aa  152  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_11314  possible hexose transporter  26.68 
 
 
476 aa  150  5e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.96677  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_08972  conserved hypothetical protein  27.29 
 
 
743 aa  149  2.0000000000000003e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01276  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09910)  26.68 
 
 
504 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.438181 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08400  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06730)  25.29 
 
 
561 aa  145  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08467  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G11050)  27.31 
 
 
532 aa  141  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  0.181108 
 
 
-
 
NC_006670  CNA08340  hexose transport-related protein, putative  26.39 
 
 
550 aa  139  8.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39560  sugar transporter, putative  25.05 
 
 
551 aa  138  2e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0538769 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09169  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  22.27 
 
 
510 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0950433  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04630  conserved hypothetical protein  27.97 
 
 
499 aa  137  5e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03090  sugar transporter, putative  23.48 
 
 
579 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57820  sugar transporter  26.12 
 
 
529 aa  136  9e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00705004  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09184  conserved hypothetical protein  26 
 
 
531 aa  136  9.999999999999999e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.90309 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00070  monosaccharide transporter, putative  24.15 
 
 
590 aa  136  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04310  monosaccharide transporter, putative  24.84 
 
 
591 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE00120  sugar transporter, putative  24.26 
 
 
539 aa  133  9e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.891292  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07667  conserved hypothetical protein  24.84 
 
 
512 aa  131  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.341465 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02475  Putative sugar transporter [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q870E7]  25.11 
 
 
490 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02544  conserved hypothetical protein  24.08 
 
 
552 aa  130  6e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07938  conserved hypothetical protein  24.5 
 
 
561 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05104  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G07700)  25.27 
 
 
576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0144049  hitchhiker  0.00149978 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55800  High-affinity Glucose Transporter (putative)  25.21 
 
 
542 aa  128  3e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02584  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G01180)  25.6 
 
 
524 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00250  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14442)  24.39 
 
 
547 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01138  Quinate permease (Quinate transporter) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P15325]  23.27 
 
 
533 aa  123  7e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.526877 
 
 
-
 
NC_006685  CNC03220  receptor, putative  24.64 
 
 
561 aa  123  8e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.630871  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06669  Putative sugar transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AYG1]  23.68 
 
 
534 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000679135  normal  0.108203 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_77210  quinate permease  23.8 
 
 
594 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.436623  normal  0.677517 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_33971  Sugar transporter, putative (STL12)  24.61 
 
 
544 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02958  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06720)  22.54 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.280694 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09168  conserved hypothetical protein-putative sugar transporter (Eurofung)  25.2 
 
 
543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.050203  normal  0.0522811 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05734  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G06960)  25.21 
 
 
524 aa  121  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39517  xylose transporter, high affinity, putative similarity to STL13  26.25 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00000189877  normal  0.584414 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09173  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00890)  26.08 
 
 
500 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_36948  high-affinity hexose (glucose) transporter  23.29 
 
 
525 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.046165  normal  0.598705 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06923  High-affinity hexose transporterPutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q874U9]  23.6 
 
 
531 aa  118  3e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01940  monosaccharide transporter, putative  23.59 
 
 
599 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05029  conserved hypothetical protein  26.39 
 
 
536 aa  117  6e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.800543  normal  0.720485 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02730  sugar transporter, putative  24.06 
 
 
545 aa  117  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02466  MFS glucose transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14170)  24.9 
 
 
536 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08464  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 
461 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3661  sugar transporter  25.99 
 
 
480 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03233  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14670)  26.72 
 
 
517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4102  sugar transporter  26.33 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08737  MSTA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J220]  24.21 
 
 
527 aa  112  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.187861  normal  0.100961 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03836  conserved hypothetical protein  25.93 
 
 
547 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02585  MFS monosaccharide transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05190)  21.84 
 
 
499 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.253437 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08448  conserved hypothetical protein  25.45 
 
 
514 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.607727 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_10658  hypothetical protein  25.06 
 
 
519 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02910  hexose transport-related protein, putative  24.12 
 
 
545 aa  108  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03498  MFS sugar transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14610)  22.96 
 
 
561 aa  107  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.966341  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00060  sugar transporter, putative  22.86 
 
 
555 aa  107  7e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36280  MFS transporter, sugar porter family  25.79 
 
 
468 aa  106  9e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33008  sugar transporter, high affinity, putative  22.69 
 
 
566 aa  106  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.348655  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01540  hexose transport-related protein, putative  23.53 
 
 
557 aa  105  2e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03220  MFS quinate transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G00990)  24.46 
 
 
570 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.889004 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03210  MFS myo-inositol transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G01560)  25.6 
 
 
633 aa  103  8e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0576803 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05200  hexose transport-related protein, putative  22.47 
 
 
535 aa  103  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0183  sugar transporter  25.7 
 
 
474 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.447711  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00540  galactose transporter, putative  22.88 
 
 
550 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  25.56 
 
 
468 aa  101  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02100  monosaccharide transporter, putative  22.02 
 
 
510 aa  101  3e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH00490  sugar transporter, putative  23.47 
 
 
592 aa  101  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.75075  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4403  sugar transporter  26.3 
 
 
492 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.92249  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2334  major facilitator superfamily protein  25.69 
 
 
446 aa  100  5e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08084  conserved hypothetical protein  22.09 
 
 
430 aa  100  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2988  arabinose-proton symporter  31.41 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.993393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0849  sugar transporter  31.41 
 
 
472 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>