64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0524 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_0662  major facilitator transporter  89.97 
 
 		 391 aa  684    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3285  major facilitator transporter  90.26 
 
 		 391 aa  684    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3168  major facilitator transporter  80.67 
 
 		 390 aa  645    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3461  major facilitator transporter  90.23 
 
 		 391 aa  676    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0524  major facilitator family transporter  100 
 
 		 388 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  71.39 
 
 		 398 aa  578  1e-164  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1006  hypothetical protein  31.67 
 
 		 136 aa  69.3  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0814  transporter protein, putative  23.36 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3982  major facilitator superfamily MFS_1  27.59 
 
 		 413 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  24.06 
 
 		 398 aa  53.9  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  25.35 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  25 
 
 		 427 aa  50.8  0.00004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3891  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  30.26 
 
 		 414 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  23.81 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.3 
 
 		 465 aa  48.9  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  23.28 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 423 aa  48.5  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  25 
 
 		 409 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  30.3 
 
 		 464 aa  48.5  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  27.78 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  26.73 
 
 		 423 aa  47.4  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  22.75 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  23.54 
 
 		 401 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  30.49 
 
 		 441 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 441 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1578  sugar transporter  28.67 
 
 		 466 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  29.03 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1863  major facilitator superfamily permease  28.57 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0147099  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  25 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  25.15 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  27.23 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  31.3 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 383 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 409 aa  44.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  26.86 
 
 		 480 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 441 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  30.15 
 
 		 400 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  30.65 
 
 		 426 aa  43.9  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07119  conserved hypothetical protein  40.32 
 
 		 619 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.740626 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4166  putative permease  27.06 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.74612 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  26.29 
 
 		 432 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  29.27 
 
 		 442 aa  43.5  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0725  major facilitator superfamily permease  32.09 
 
 		 490 aa  43.1  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.29773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5588  putative multidrug resistance protein, emrB-like protein  29.06 
 
 		 525 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.339055  normal  0.392852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0251  major facilitator transporter  27.82 
 
 		 458 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0828  major facilitator superfamily aromatic acid/H(+) symporter  26.87 
 
 		 450 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.420618  normal  0.255495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  21.96 
 
 		 401 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>