73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3285 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0524  major facilitator family transporter  90.26 
 
 		 388 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.134681 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3461  major facilitator transporter  98.21 
 
 		 391 aa  764    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.340175 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0662  major facilitator transporter  98.47 
 
 		 391 aa  766    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.644367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3285  major facilitator transporter  100 
 
 		 391 aa  776    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3168  major facilitator transporter  79.95 
 
 		 390 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0940  major facilitator family transporter  71.54 
 
 		 398 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0814  transporter protein, putative  24.26 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.591917  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1006  hypothetical protein  31.67 
 
 		 136 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3982  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5384  major facilitator transporter  24.4 
 
 		 409 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2860  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.085124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  26.95 
 
 		 443 aa  50.1  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1310  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 401 aa  50.1  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0992483  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1383  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 401 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1399  major facilitator transporter  24.6 
 
 		 401 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0675  hypothetical protein  24 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0692  hypothetical protein  24 
 
 		 427 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0691  hypothetical protein  25.85 
 
 		 423 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3599  major facilitator transporter  29.49 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00583195  normal  0.308839 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1422  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 401 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0674  hypothetical protein  25.37 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04810  major facilitator superfamily MFS_1  24.29 
 
 		 423 aa  47.8  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.332463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1160  sugar transporter  32.99 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0565582  hitchhiker  0.000112742 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3546  major facilitator transporter  24.1 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.460854 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3330  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00323998  normal  0.618679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3338  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.0071419  normal  0.395807 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3265  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0111445  normal  0.101317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3254  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000516746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3434  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.444066  normal  0.014218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2955  major facilitator superfamily MFS_1  24.34 
 
 		 401 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.325487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1559b  transporter, MFS superfamily  29.05 
 
 		 384 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.423299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0926  putative hexuronate transporter  27.92 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3361  putative hexuronate transporter  27.92 
 
 		 435 aa  47  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3891  major facilitator superfamily MFS_1  29.6 
 
 		 404 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0752  sugar transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.718529  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3375  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3085  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0156709  hitchhiker  0.000187462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0771  sugar transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00259481  hitchhiker  0.000457793 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4246  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.487781  normal  0.587718 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02736  hypothetical protein  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.39424  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3101  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3286  galactose-proton symporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.583808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02773  D-galactose transporter  31.52 
 
 		 464 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.255079  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0627  major facilitator family transporter  28.38 
 
 		 439 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2041  major facilitator superfamily MFS_1  29.96 
 
 		 397 aa  45.8  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3347  sugar transporter  30.85 
 
 		 465 aa  46.2  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0767559  decreased coverage  0.00268397 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2468  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 409 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  29.41 
 
 		 426 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  32.82 
 
 		 518 aa  44.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3315  major facilitator family transporter  29.5 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.35 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  24.66 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  26.44 
 
 		 424 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2768  major facilitator superfamily MFS_1  28.42 
 
 		 421 aa  44.3  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.17695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6060  Bcr/CflA family drug resistance transporter  25.38 
 
 		 414 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.83 
 
 		 460 aa  43.9  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1829  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 388 aa  43.9  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4044  putative permease  28.24 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  28.34 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  28.34 
 
 		 426 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  27.52 
 
 		 449 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1170  major facilitator transporter  24.15 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.901333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  23.13 
 
 		 428 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  22.79 
 
 		 427 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  27.12 
 
 		 480 aa  43.5  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  24.84 
 
 		 436 aa  43.5  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4117  putative permease  27.65 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.477286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.17 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1313  major facilitator transporter  27.85 
 
 		 433 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.720769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  27.12 
 
 		 441 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33078  putative xylose transporter  24.58 
 
 		 495 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.442314 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>