65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3757 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  303  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  98.68 
 
 		 153 aa  296  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  96.73 
 
 		 153 aa  272  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  91.28 
 
 		 149 aa  271  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  84.67 
 
 		 152 aa  260  4.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  81.33 
 
 		 157 aa  243  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  80.67 
 
 		 157 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  80.67 
 
 		 157 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  80.67 
 
 		 157 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  71.62 
 
 		 149 aa  217  5e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  70.27 
 
 		 150 aa  213  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  69.33 
 
 		 150 aa  187  4e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  70.07 
 
 		 149 aa  180  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  53.1 
 
 		 149 aa  154  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  61.9 
 
 		 155 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  50.34 
 
 		 145 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  34.23 
 
 		 149 aa  98.2  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  36.3 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  35.56 
 
 		 146 aa  87.8  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  37.8 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  29.41 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  36.03 
 
 		 171 aa  82.8  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  31.69 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  31.29 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  34.62 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  27.15 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  29.33 
 
 		 161 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  35.71 
 
 		 151 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  35.85 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  26.35 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  25.97 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  28.86 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  28.67 
 
 		 161 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  27.89 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  27.21 
 
 		 175 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  29.41 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  34.13 
 
 		 154 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  32.21 
 
 		 158 aa  72  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  26.35 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  28.28 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  26.67 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  25.68 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  28.57 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  29.91 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  26.21 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  26.83 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  25.5 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  26.12 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  25.2 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  25.2 
 
 		 159 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  28.57 
 
 		 172 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  23.68 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  29.67 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  27.63 
 
 		 158 aa  47  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  26.72 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  29.67 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  28.1 
 
 		 216 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  23.61 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  29.27 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  27.52 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  31.52 
 
 		 172 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  24.56 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  24.56 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  28.28 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>