66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2970 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  319  7e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  59.74 
 
 		 161 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  60 
 
 		 161 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  55.7 
 
 		 169 aa  181  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  40.85 
 
 		 159 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  38 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  38.16 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  38.03 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  38.03 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  36.73 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  39.6 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  43.2 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  37.75 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  37.32 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  46.36 
 
 		 172 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  36.73 
 
 		 149 aa  90.1  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  37.04 
 
 		 159 aa  87.4  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  34.67 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  31.87 
 
 		 157 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  33.57 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  30.77 
 
 		 126 aa  73.6  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  32.33 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  32.17 
 
 		 149 aa  70.9  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  32.28 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  30.52 
 
 		 154 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  28.57 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  27.89 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  27.33 
 
 		 149 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  33.33 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  32.2 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  25.18 
 
 		 149 aa  63.5  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  28.28 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  26.06 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  24.65 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  29.92 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  24.82 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  32.11 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  32.87 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  31.07 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  28.33 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  31.73 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  27.52 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  33.33 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  32.26 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  29.2 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  35.62 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  35.62 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  27.48 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  26.35 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  29.13 
 
 		 216 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  29.13 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  30.67 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  35.94 
 
 		 161 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  28.91 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  28.79 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  24.75 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0961  hypothetical protein  29.2 
 
 		 257 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.483965  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  24.22 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0189  protein of unknown function DUF1332  26.8 
 
 		 310 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.936864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>