68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0370 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  278  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  99.31 
 
 		 145 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  88.19 
 
 		 161 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  64.14 
 
 		 146 aa  169  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  56.64 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  58.74 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  56.25 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1708  hypothetical protein  38.03 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  33.57 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  35.21 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  35.21 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  39.23 
 
 		 154 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  70.9  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  38.73 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  36.52 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  37.6 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  29.58 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  30.95 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  33.79 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  30.67 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  30.67 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  29.79 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  35.85 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  37.96 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  29.46 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  31.51 
 
 		 175 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  31.76 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  27.42 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  33.96 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  30.83 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  32.2 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  30.4 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  28.47 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  31.62 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  30.63 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  30.63 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  31.97 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  30.25 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  32.35 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  30 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  29.2 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  30.63 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  29.2 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  29.6 
 
 		 159 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  30.09 
 
 		 170 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  30.63 
 
 		 157 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  30.63 
 
 		 157 aa  50.8  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  29.2 
 
 		 153 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  31.62 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  26.28 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  35.09 
 
 		 159 aa  48.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  27.78 
 
 		 126 aa  47  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  28.67 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  31.25 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1302  hypothetical protein  29.82 
 
 		 148 aa  44.3  0.0005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  35.85 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  34.87 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1265  hypothetical protein  28.67 
 
 		 164 aa  43.5  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  32.89 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0892  Dna-J like membrane chaperone protein  31.53 
 
 		 257 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.448212  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  33.82 
 
 		 216 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1548  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176844 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2441  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  28.7 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.525604  hitchhiker  0.00758559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0785  putative heat shock protein DnaJ  28.7 
 
 		 227 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0395  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.57 
 
 		 227 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.32724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>