63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3707 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  295  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  55.94 
 
 		 146 aa  137  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  51.39 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  56.25 
 
 		 145 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  56.25 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  51.05 
 
 		 146 aa  115  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  56.25 
 
 		 161 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1708  hypothetical protein  41.55 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  33.33 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  38.56 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  37.06 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  30.07 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  39.07 
 
 		 151 aa  73.6  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  36.44 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  30.07 
 
 		 161 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  31.33 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  34.96 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  32.37 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  32.87 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  32.87 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  32.65 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  31.78 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  32.61 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  41.41 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  30.99 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  31.4 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  28.24 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  25.87 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  26.15 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  26.12 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  26.28 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  31.53 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  27.48 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  27.48 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  30.22 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  26.71 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  26.72 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  26.87 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  27.01 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  24.44 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  26.28 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  32.41 
 
 		 156 aa  51.6  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  36.61 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  26.36 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  30.53 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  25.56 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  27.94 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  32.79 
 
 		 153 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  28 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  26.8 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  33.64 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  33.98 
 
 		 175 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  31.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  28.7 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  33.33 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  27.12 
 
 		 151 aa  43.9  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  32.33 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  24.63 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  32.33 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  30.17 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  32.79 
 
 		 155 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>