63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0189 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  100 
 
 
157 aa  313  6e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  99.36 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  99.36 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  97.45 
 
 
157 aa  306  9e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  86.67 
 
 
152 aa  259  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  82.55 
 
 
149 aa  244  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  81.33 
 
 
153 aa  224  4e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  81.33 
 
 
153 aa  223  8e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  80.67 
 
 
153 aa  223  1e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  65.54 
 
 
149 aa  207  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  64 
 
 
150 aa  204  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  66.67 
 
 
150 aa  180  7e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  65.07 
 
 
149 aa  173  8e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  51.03 
 
 
149 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  61.64 
 
 
155 aa  144  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  47.59 
 
 
145 aa  130  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  33.56 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  36.22 
 
 
145 aa  84  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  30 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  37.61 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  32.39 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  34.09 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  36.44 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  31.69 
 
 
150 aa  77  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  34.06 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  27.95 
 
 
159 aa  74.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  29.61 
 
 
161 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  38.97 
 
 
154 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  33.96 
 
 
159 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  28.48 
 
 
159 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  30 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  29.19 
 
 
155 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  28.29 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  30 
 
 
158 aa  68.6  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  26.9 
 
 
158 aa  67  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  27.89 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  29.66 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  28 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  26.03 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  30.15 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  31.33 
 
 
157 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  27.33 
 
 
170 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  29.75 
 
 
175 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  27.59 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  24.66 
 
 
169 aa  60.8  0.000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  27.35 
 
 
156 aa  59.7  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  26.06 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  24.63 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  27.52 
 
 
160 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  23.78 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  25.6 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  25.6 
 
 
159 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  23.14 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  28.38 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  27.97 
 
 
216 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  30.43 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  27.97 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  26.47 
 
 
158 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  29.67 
 
 
145 aa  44.3  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  29.67 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  26.28 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  24.32 
 
 
146 aa  40.8  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>