41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2423 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  100 
 
 		 157 aa  313  7e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  47.46 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  32.79 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  38.02 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  29.53 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  32.64 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  29.25 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  70.9  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  30.72 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  28 
 
 		 149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  27.39 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  29.25 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  33.04 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  29.58 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  28.46 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  30.61 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  31.33 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  31.33 
 
 		 157 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  31.33 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  31.06 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  29.17 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  27.54 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  28.77 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  26.89 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  28.32 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  26.67 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  26.71 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  24.64 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  29.69 
 
 		 151 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  25.81 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  25.81 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  27.85 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  27.22 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  28.26 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  24.68 
 
 		 159 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  28 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  23.19 
 
 		 156 aa  41.2  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>