64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3198 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  315  2e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  52.98 
 
 
159 aa  155  3e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  52.98 
 
 
159 aa  155  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  41.45 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  41.45 
 
 
161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  40 
 
 
159 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  38.89 
 
 
169 aa  117  7.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  39.07 
 
 
159 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  39.74 
 
 
158 aa  117  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  50.33 
 
 
172 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  40.54 
 
 
155 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  41.1 
 
 
175 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  43.8 
 
 
159 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  38.51 
 
 
170 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  34.46 
 
 
159 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  34.44 
 
 
159 aa  94  6e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  35.71 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  31.37 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  32.59 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  34 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  37.8 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  27.64 
 
 
149 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  26.19 
 
 
152 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  32.31 
 
 
171 aa  67.8  0.00000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  28.21 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  27.35 
 
 
157 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  28.21 
 
 
157 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  33.98 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  27.35 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  27.87 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  27.42 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  26.06 
 
 
149 aa  61.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  27.68 
 
 
150 aa  60.5  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  28.95 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  26.83 
 
 
153 aa  58.9  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  24.65 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  30.37 
 
 
154 aa  58.9  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  32.11 
 
 
216 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  57.8  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  31.82 
 
 
158 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  32.63 
 
 
172 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  25.93 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  31.82 
 
 
158 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  28.23 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  28.7 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  30.7 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  28.03 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  30.7 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  27.64 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  27.1 
 
 
150 aa  52  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  25.64 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  29.2 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  29.81 
 
 
145 aa  48.5  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  30.84 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  31.72 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  30.84 
 
 
145 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  23.19 
 
 
157 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  20.83 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  26.47 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>