53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3939 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  99.37 
 
 		 216 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  100 
 
 		 158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  92.41 
 
 		 158 aa  263  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  59.46 
 
 		 153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  57.43 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  56.94 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  36.76 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  36.84 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  33.78 
 
 		 159 aa  73.6  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  34 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  35.53 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  32.67 
 
 		 149 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  36.28 
 
 		 159 aa  63.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  35.09 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  30.41 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  33.33 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  29.8 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  32.11 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  34.26 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  28.86 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  26.98 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  26.98 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  30.43 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  31.25 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  27.01 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  28.04 
 
 		 161 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  27.97 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  28.81 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  28.81 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  34.38 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  38.68 
 
 		 171 aa  50.8  0.000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  27.97 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  33.55 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  23.49 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  27.05 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  33.11 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  27.05 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  25.45 
 
 		 157 aa  47.4  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  27.73 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  27.63 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  26.97 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  27.05 
 
 		 146 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  27.63 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  30.23 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  32 
 
 		 246 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  27.05 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  28.38 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  27.82 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0189  protein of unknown function DUF1332  29.51 
 
 		 310 aa  40.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.936864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  27.97 
 
 		 154 aa  40.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  26.21 
 
 		 151 aa  40.4  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>