58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3454 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  293  6e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  49.66 
 
 		 149 aa  140  6e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  49.66 
 
 		 152 aa  136  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  48.28 
 
 		 157 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  47.59 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  129  9e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  47.59 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  47.59 
 
 		 157 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  50.34 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  47.59 
 
 		 149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  47.59 
 
 		 150 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  46.62 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  56.76 
 
 		 150 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  51.69 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  52.41 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  87.8  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  39.67 
 
 		 171 aa  84.7  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  31.29 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  33.09 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  31.54 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  31.54 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  30.4 
 
 		 149 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  28.87 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  31.78 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  31.3 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  32.64 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  30.77 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  29.46 
 
 		 175 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  26.52 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  30.71 
 
 		 170 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  26.52 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  31.09 
 
 		 151 aa  61.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  27.21 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  31.06 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  27.35 
 
 		 155 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  31.25 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  27.2 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  30.2 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  27.2 
 
 		 161 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  32.18 
 
 		 158 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  26.4 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  25.93 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  28.36 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  23.31 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  24.8 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  24.8 
 
 		 159 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  26.67 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  24 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  22.86 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  23.48 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  27.73 
 
 		 216 aa  42  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  23.97 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  27.73 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  24.22 
 
 		 159 aa  41.2  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  26.71 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  27.73 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  25.44 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>