57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3499 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  296  9e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  53.79 
 
 		 149 aa  153  6e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  53.79 
 
 		 153 aa  152  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  53.1 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  53.1 
 
 		 153 aa  150  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  51.72 
 
 		 157 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  51.72 
 
 		 149 aa  148  2e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  51.03 
 
 		 152 aa  148  3e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  51.03 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  51.03 
 
 		 157 aa  146  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  51.03 
 
 		 157 aa  146  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  48.28 
 
 		 150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  53.1 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  51.03 
 
 		 150 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  46.62 
 
 		 145 aa  124  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  48.37 
 
 		 155 aa  114  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  33.56 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  31.41 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  37.88 
 
 		 146 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  37.12 
 
 		 146 aa  84.3  5e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  33.8 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  31.36 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  31.72 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  33.87 
 
 		 171 aa  75.1  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  34.71 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  29.03 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  29.03 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  30.87 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  30.87 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  30.2 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  35.46 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  28.57 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  27.39 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  27.03 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  25.18 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  28.57 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  26.45 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  29.32 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  26.97 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  32.84 
 
 		 158 aa  60.8  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  60.1  0.000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  27.03 
 
 		 159 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  27.1 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  27.87 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  25.69 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  22.22 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  27.62 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  24.79 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  24.79 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  26.12 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  26.53 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  24.53 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  22.61 
 
 		 146 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>