62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0114 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  90.57 
 
 		 158 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  85.03 
 
 		 175 aa  262  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  77.71 
 
 		 170 aa  247  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  66.67 
 
 		 159 aa  223  8e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  67.3 
 
 		 159 aa  222  1e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  67.3 
 
 		 155 aa  213  9e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  49.67 
 
 		 172 aa  127  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  47.1 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  38.75 
 
 		 159 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  38.16 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  39.07 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  40.28 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  36.42 
 
 		 161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  35.76 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  37.25 
 
 		 169 aa  106  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  37.59 
 
 		 157 aa  99.8  1e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  31.72 
 
 		 149 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  29.25 
 
 		 149 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  29.66 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  28.48 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  29.11 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  28.48 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  30.2 
 
 		 149 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  28.97 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  28.38 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  27.7 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  28.87 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  27.7 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  31.3 
 
 		 157 aa  67  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  32.89 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  32.65 
 
 		 147 aa  67  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  36.18 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  32.89 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  29.38 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  35.53 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  32.26 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  31.78 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  28.76 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  37.04 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  35.95 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  28.45 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  31.03 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  38.3 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  31.9 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  32.2 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  29.85 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  30.89 
 
 		 151 aa  57.4  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  28.95 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  29.75 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  25.52 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  33.62 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  29.68 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  28.81 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  27.27 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  30.49 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  26.05 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  28 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  39.29 
 
 		 153 aa  40.8  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>