52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3930 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  100 
 
 		 158 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  93.04 
 
 		 216 aa  263  5.999999999999999e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  92.41 
 
 		 158 aa  263  8.999999999999999e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  59.6 
 
 		 153 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  55.41 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  56.25 
 
 		 172 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  39.02 
 
 		 157 aa  80.1  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  33.78 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  36.18 
 
 		 159 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  34.87 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  34.87 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  36.28 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  29.73 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  35.82 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  30.67 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  35.43 
 
 		 155 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  33.6 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  38 
 
 		 172 aa  57.4  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  32.11 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  29.1 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  27.78 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  27.78 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  30.4 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  31.25 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  30.28 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  34.38 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  29.13 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  27.01 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  27.21 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  26.47 
 
 		 157 aa  50.8  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  34.46 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  38.68 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  26.89 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  36.15 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  27.94 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  26.47 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  28.23 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  24.26 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  27.73 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  25.45 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  26.89 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  31.01 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  29.27 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  26.89 
 
 		 151 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  27.18 
 
 		 151 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  26.89 
 
 		 146 aa  41.2  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2006  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  29.46 
 
 		 246 aa  40.8  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0210769 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  33.33 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0189  protein of unknown function DUF1332  30.25 
 
 		 310 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.936864 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>