47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1856 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  330  9e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0663  protein of unknown function DUF1332  83.87 
 
 		 160 aa  222  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  56.67 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  56.95 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  56.16 
 
 		 153 aa  139  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  56.95 
 
 		 158 aa  134  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  38.06 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  36.03 
 
 		 159 aa  75.1  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  31.34 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  39.25 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  35.34 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  32.5 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  32.53 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  35.77 
 
 		 172 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  34.26 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  35.34 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  30.88 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  29.5 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  28.57 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  29.5 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  28.46 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  30.88 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  30.88 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  30.88 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  29.93 
 
 		 152 aa  57.8  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  28.36 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  28 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  24.67 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  29.41 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  30.94 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  27.73 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  31.5 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  30.95 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  31.4 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  33.87 
 
 		 147 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  31.15 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  34.43 
 
 		 151 aa  47.4  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  27.35 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  27.93 
 
 		 150 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  25 
 
 		 149 aa  45.1  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  26.89 
 
 		 145 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  27.08 
 
 		 160 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  30.33 
 
 		 171 aa  42  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  22.41 
 
 		 149 aa  41.6  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>