61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003554 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  297  3e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  85.62 
 
 		 146 aa  263  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  65.03 
 
 		 154 aa  191  4e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  52.38 
 
 		 151 aa  159  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  35.06 
 
 		 157 aa  94.4  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  34.03 
 
 		 171 aa  93.2  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  41.88 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  37.12 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  34.81 
 
 		 149 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  37.88 
 
 		 149 aa  85.5  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  42.59 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  31.97 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  36.3 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0286  hypothetical protein  39.32 
 
 		 149 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  36.75 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  34.09 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  34.09 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  34.09 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  34.09 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  36.75 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  36.3 
 
 		 159 aa  75.9  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  32.89 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1845  hypothetical protein  33.79 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.176164  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  31.54 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  32.5 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2925  hypothetical protein  37.27 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  70.5  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  30.77 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  30.77 
 
 		 161 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  32.28 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  30.61 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  33.33 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2423  protein of unknown function DUF1332  29.25 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  31.39 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  31.39 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  27.97 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  30.66 
 
 		 159 aa  63.9  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3963  hypothetical protein  36.11 
 
 		 155 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  28.99 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  31.78 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  27.68 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  30.84 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  36.17 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  30.51 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  31.36 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  28.7 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  28.81 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  29.31 
 
 		 159 aa  53.9  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  29.06 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  25.69 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  26.83 
 
 		 153 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  26.89 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  27.05 
 
 		 158 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  27.05 
 
 		 216 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  44.23 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1856  hypothetical protein  30.12 
 
 		 172 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.827405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>