23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3009 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  100 
 
 
151 aa  306  4e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  90.07 
 
 
151 aa  285  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3017  Tellurite resistance TerB  53.64 
 
 
151 aa  169  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000389942  decreased coverage  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  52.32 
 
 
151 aa  159  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  49.66 
 
 
152 aa  153  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5626  putative tellurium resistance protein  46.53 
 
 
358 aa  141  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  43.67 
 
 
300 aa  136  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  43.75 
 
 
332 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  37.75 
 
 
149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  37.09 
 
 
149 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  33.11 
 
 
150 aa  99  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  33.56 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  31.72 
 
 
150 aa  94.4  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  32.45 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1352  TerB  26.49 
 
 
151 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  0.570611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3787  tellurite resistance protein  26.49 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000180248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3875  tellurite resistance TerB  26.49 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000149484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0664  tellurite resistance protein  26.49 
 
 
151 aa  77.8  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000717053  normal  0.35704 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3696  Tellurite resistance TerB  27.15 
 
 
151 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  29.06 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  26.85 
 
 
143 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2273  hypothetical protein  28.35 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.205894  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1548  hypothetical protein  27.19 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0176844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>