23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0942 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  100 
 
 		 149 aa  298  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  97.99 
 
 		 149 aa  294  3e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  73.83 
 
 		 149 aa  230  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  66.44 
 
 		 149 aa  206  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  53.06 
 
 		 150 aa  170  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  51.35 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1352  TerB  41.61 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  0.570611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3787  tellurite resistance protein  42.57 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000180248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3875  tellurite resistance TerB  42.57 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000149484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0664  tellurite resistance protein  42.57 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000717053  normal  0.35704 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  42.28 
 
 		 151 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3696  Tellurite resistance TerB  40.27 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  39.46 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3017  Tellurite resistance TerB  41.5 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000389942  decreased coverage  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  37.09 
 
 		 151 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  35.1 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  38.17 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  35.04 
 
 		 300 aa  84  7e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5626  putative tellurium resistance protein  33.09 
 
 		 358 aa  73.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  27.74 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  30.47 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1548  hypothetical protein  30.23 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176844 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2273  hypothetical protein  27.42 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.205894  normal  0.0669225 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>