23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0891 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  100 
 
 
150 aa  307  2.9999999999999997e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  55.63 
 
 
150 aa  173  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  54.42 
 
 
149 aa  173  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  53.06 
 
 
149 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  53.74 
 
 
149 aa  167  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  51.02 
 
 
149 aa  159  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1352  TerB  43.05 
 
 
151 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  0.570611 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3787  tellurite resistance protein  40.4 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000180248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3696  Tellurite resistance TerB  42.38 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3875  tellurite resistance TerB  40.4 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000149484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0664  tellurite resistance protein  40.4 
 
 
151 aa  132  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000717053  normal  0.35704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  39.74 
 
 
152 aa  118  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3017  Tellurite resistance TerB  33.77 
 
 
151 aa  100  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000389942  decreased coverage  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  33.11 
 
 
151 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  31.79 
 
 
151 aa  94.7  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  38.17 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  31.79 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  32.03 
 
 
300 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5626  putative tellurium resistance protein  31.65 
 
 
358 aa  73.2  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  24.31 
 
 
332 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  28 
 
 
143 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2273  hypothetical protein  29.84 
 
 
150 aa  47  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.205894  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1548  hypothetical protein  26.36 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0176844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>