24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3770 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  100 
 
 
152 aa  307  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3017  Tellurite resistance TerB  59.06 
 
 
151 aa  184  3e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000389942  decreased coverage  0.0000328621 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  55.63 
 
 
151 aa  179  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  49.66 
 
 
151 aa  153  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  48.99 
 
 
151 aa  152  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  40.82 
 
 
149 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  39.46 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  41.61 
 
 
149 aa  123  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  39.74 
 
 
150 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  41.5 
 
 
149 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3787  tellurite resistance protein  38.26 
 
 
151 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000180248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3875  tellurite resistance TerB  38.26 
 
 
151 aa  114  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000149484  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0664  tellurite resistance protein  38.26 
 
 
151 aa  114  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000717053  normal  0.35704 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1352  TerB  36.42 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000857143  normal  0.570611 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  38.36 
 
 
150 aa  111  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3696  Tellurite resistance TerB  35.1 
 
 
151 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0390345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2430  tellurite resistance TerB  39.26 
 
 
332 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.333717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  39.26 
 
 
300 aa  100  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5626  putative tellurium resistance protein  40.62 
 
 
358 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00291797  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  29.77 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  23.2 
 
 
143 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2273  hypothetical protein  25.38 
 
 
150 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.205894  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1548  hypothetical protein  25.58 
 
 
145 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0176844 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  30.77 
 
 
832 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>