11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_1548 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1548  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0176844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2191  TerB  34.23 
 
 		 143 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0122753  hitchhiker  0.000000525485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  31.01 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  30.23 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  29.46 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  28.68 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  26.36 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  25.44 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  27.19 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  25.58 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  28.57 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.606644 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>