13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2273 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2273  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  296  9e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.205894  normal  0.0669225 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1940  tellurite resistance TerB  29.13 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0942  tellurium resistance protein TerB  27.42 
 
 
149 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0810  tellurite resistance TerB  27.42 
 
 
149 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0304003  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09850  Tellurite resistance TerB  28.86 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0891  tellurite resistance TerB  29.84 
 
 
150 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3009  tellurite resistance TerB  28.35 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380489  normal  0.262781 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0058  tellurite resistance protein-like  31.4 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3770  Tellurite resistance TerB  25.38 
 
 
152 aa  45.1  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.419772 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0272  tellurite resistance TerB  26.53 
 
 
149 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1272  tellurite resistance TerB  31.3 
 
 
151 aa  43.9  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1001  tellurite resistance TerB  27.03 
 
 
150 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.110378  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3433  NUDIX hydrolase  32.43 
 
 
300 aa  41.6  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>