59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2220 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2220  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  285  2e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1709  hypothetical protein  60.96 
 
 		 147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1136  hypothetical protein  67.59 
 
 		 146 aa  163  8e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.863269  normal  0.342516 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2014  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0188674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0370  hypothetical protein  64.14 
 
 		 145 aa  147  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0871  hypothetical protein  65.03 
 
 		 161 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3707  hypothetical protein  55.94 
 
 		 153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1708  hypothetical protein  39.58 
 
 		 152 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1696  hypothetical protein  43.84 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.290801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2294  hypothetical protein  40.16 
 
 		 149 aa  87.4  6e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000519813  normal  0.553436 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0076  hypothetical protein  42.5 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.193644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4149  hypothetical protein  33.6 
 
 		 169 aa  75.1  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.640166  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0424  protein of unknown function DUF1332  31.82 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3703  protein of unknown function DUF1332  32.86 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.814089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4024  protein of unknown function DUF1332  32.86 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.37493  normal  0.960415 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0605  hypothetical protein  32.84 
 
 		 159 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1920  hypothetical protein  34.72 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0275  hypothetical protein  34.11 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0476  hypothetical protein  31.06 
 
 		 159 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2116  hypothetical protein  37.84 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.627377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0688  hypothetical protein  30.83 
 
 		 158 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1882  hypothetical protein  32.31 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1811  hypothetical protein  32.31 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.828251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0114  hypothetical protein  31.11 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.544151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0979  hypothetical protein  31.72 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.145675  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0054  hypothetical protein  31.39 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2028  hypothetical protein  36.43 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2970  hypothetical protein  30.94 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1599  hypothetical protein  28.97 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1818  hypothetical protein  32.37 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02515  hypothetical protein  31.25 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1484  hypothetical protein  25.98 
 
 		 157 aa  57  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0056262  normal  0.976718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3198  hypothetical protein  33.86 
 
 		 156 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1840  protein of unknown function DUF1332  37.3 
 
 		 172 aa  56.2  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0425637 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3245  hypothetical protein  31.88 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4562  hypothetical protein  28.67 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2767  hypothetical protein  35.14 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0318  hypothetical protein  28.57 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.355873  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3390  hypothetical protein  29.93 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.515399  normal  0.0925664 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0246  hypothetical protein  26.39 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2179  hypothetical protein  28.46 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.110663 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0247  hypothetical protein  24.67 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4279  hypothetical protein  24.82 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.061664 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3930  protein of unknown function DUF1332  35.14 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.232156 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3939  protein of unknown function DUF1332  33.78 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3757  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0189  protein of unknown function DUF1332  25.69 
 
 		 157 aa  47.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4146  hypothetical protein  24.82 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0188  hypothetical protein  24.82 
 
 		 157 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003554  hypothetical protein  27.52 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0508881  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3830  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3955  hypothetical protein  27.27 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3595  hypothetical protein  29.2 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0538316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2850  hypothetical protein  27.64 
 
 		 151 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.289824  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01718  hypothetical protein  28.97 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3454  hypothetical protein  28.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3646  hypothetical protein  33.11 
 
 		 216 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3499  hypothetical protein  22.76 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000117371  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0994  hypothetical protein  28.24 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>