92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0960 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  628  1e-179  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  78.39 
 
 		 310 aa  494  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  76.6 
 
 		 315 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  75 
 
 		 305 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  75.4 
 
 		 311 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  74.5 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  74.83 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  75.5 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  74.5 
 
 		 304 aa  457  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  75.5 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  75.17 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  75.84 
 
 		 304 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  73.68 
 
 		 309 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  74.5 
 
 		 304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  74.83 
 
 		 292 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  72.48 
 
 		 307 aa  429  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  66.12 
 
 		 305 aa  405  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  67.03 
 
 		 308 aa  381  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  65.02 
 
 		 306 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  64.73 
 
 		 293 aa  379  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  56.03 
 
 		 312 aa  321  9.000000000000001e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  51.15 
 
 		 309 aa  291  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  48.25 
 
 		 294 aa  263  2e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  44.77 
 
 		 329 aa  256  5e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  44.44 
 
 		 314 aa  235  9e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  44.74 
 
 		 307 aa  232  5e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  42.66 
 
 		 313 aa  232  7.000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  42.67 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  42.95 
 
 		 316 aa  230  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  48.5 
 
 		 309 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  42.77 
 
 		 317 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  47.11 
 
 		 341 aa  213  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  47.5 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  46.69 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  46.53 
 
 		 337 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  41.76 
 
 		 330 aa  192  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  41.99 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  40.41 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  42.4 
 
 		 284 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  39.5 
 
 		 292 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  38.46 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  38.68 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  40.5 
 
 		 297 aa  149  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  29.48 
 
 		 342 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  35.34 
 
 		 565 aa  133  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  35.92 
 
 		 320 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  33.33 
 
 		 308 aa  127  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  35.97 
 
 		 305 aa  126  6e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  33.59 
 
 		 314 aa  121  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  32 
 
 		 337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  35.1 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  34.54 
 
 		 278 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  34.66 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  35.46 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  35.56 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  108  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  34.41 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  32.96 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  33.33 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  31.69 
 
 		 355 aa  106  6e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  34.58 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  28.77 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  33.07 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  33.07 
 
 		 283 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  32.39 
 
 		 268 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  28.52 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  29.25 
 
 		 279 aa  93.6  4e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  30.45 
 
 		 286 aa  90.1  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  28.63 
 
 		 249 aa  89.4  8e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  29.43 
 
 		 320 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  29.07 
 
 		 301 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  28.97 
 
 		 303 aa  86.3  6e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  30.77 
 
 		 283 aa  86.3  7e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  30.24 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  30.04 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  27.95 
 
 		 286 aa  82  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  29.5 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  28.4 
 
 		 253 aa  75.1  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  26.75 
 
 		 248 aa  72.8  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  26.69 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  28.96 
 
 		 285 aa  68.9  0.00000000009  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  24.11 
 
 		 270 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  27.5 
 
 		 278 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  33.03 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  34.57 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>