93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1038 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  613  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  84.19 
 
 		 315 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  78.39 
 
 		 316 aa  494  1e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  73.68 
 
 		 305 aa  463  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  74.01 
 
 		 304 aa  462  1e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  73.03 
 
 		 304 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  72.7 
 
 		 304 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  72.37 
 
 		 304 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  72.37 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  72.7 
 
 		 304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  72.04 
 
 		 304 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  72.37 
 
 		 304 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  72.49 
 
 		 311 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  71.19 
 
 		 309 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  72.26 
 
 		 292 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  69.23 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  64.47 
 
 		 305 aa  397  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  64.69 
 
 		 308 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  62.62 
 
 		 306 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  63.67 
 
 		 293 aa  376  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  55.12 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  46.89 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  47.84 
 
 		 294 aa  263  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  48.44 
 
 		 329 aa  261  6.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  46.03 
 
 		 314 aa  243  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  41.31 
 
 		 332 aa  231  1e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  45.03 
 
 		 317 aa  228  9e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  43.09 
 
 		 307 aa  227  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  40.96 
 
 		 313 aa  226  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  41.78 
 
 		 316 aa  222  7e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  46.64 
 
 		 309 aa  221  9.999999999999999e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  46.15 
 
 		 337 aa  204  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  41.39 
 
 		 324 aa  200  3e-50  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  43.62 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  39.6 
 
 		 294 aa  194  2e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  41.6 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  39.46 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  40.15 
 
 		 330 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  43.32 
 
 		 284 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  40.76 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  40.33 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  36.51 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  37.45 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  29.39 
 
 		 342 aa  138  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  35.25 
 
 		 320 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  36.25 
 
 		 565 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  35.42 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  32.57 
 
 		 308 aa  126  6e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  32.09 
 
 		 337 aa  120  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  32.61 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  32.16 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  34.12 
 
 		 268 aa  112  9e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  32.37 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  35.16 
 
 		 268 aa  109  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  33.19 
 
 		 253 aa  109  6e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  35.55 
 
 		 268 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  35.55 
 
 		 268 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  31.82 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  33.07 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  32.13 
 
 		 278 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  34.71 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  103  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  29.08 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  29.47 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  33.07 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  32.95 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  29.88 
 
 		 279 aa  94.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  29.43 
 
 		 320 aa  90.9  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  31.06 
 
 		 249 aa  86.7  4e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  29.92 
 
 		 286 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  32.17 
 
 		 286 aa  84.7  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  30.95 
 
 		 285 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  29.53 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  30.03 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  30.24 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  29.96 
 
 		 283 aa  79.7  0.00000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  28.23 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  27.2 
 
 		 270 aa  76.3  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  30.23 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  30.18 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  27.07 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 183 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  25.94 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  34.52 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  24.3 
 
 		 289 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>