93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5992 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  100 
 
 
316 aa  611  9.999999999999999e-175  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  43.36 
 
 
297 aa  155  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  40.24 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  34.81 
 
 
320 aa  140  3e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  38 
 
 
308 aa  139  6e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  38.98 
 
 
307 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  40.55 
 
 
312 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  35.69 
 
 
341 aa  138  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  37.45 
 
 
294 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  34.27 
 
 
306 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  36.74 
 
 
319 aa  132  6e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  36.36 
 
 
305 aa  132  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  37.45 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  37.15 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  32.9 
 
 
316 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  35.09 
 
 
307 aa  128  1.0000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  38.15 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  36.33 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  36.61 
 
 
304 aa  127  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  36.61 
 
 
304 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  36.61 
 
 
304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  35.29 
 
 
315 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  35.71 
 
 
316 aa  125  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  35.32 
 
 
304 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  35.32 
 
 
304 aa  125  9e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  35.57 
 
 
304 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  35.2 
 
 
310 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  38.76 
 
 
309 aa  124  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  37.36 
 
 
324 aa  123  3e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  34.92 
 
 
304 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  33.46 
 
 
332 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  38.46 
 
 
292 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  35.39 
 
 
294 aa  122  6e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  37.21 
 
 
329 aa  122  7e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  37.85 
 
 
317 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  33.44 
 
 
565 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  33.55 
 
 
309 aa  118  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  35.71 
 
 
311 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  34.57 
 
 
293 aa  117  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  35.74 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  33.83 
 
 
309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  36.73 
 
 
355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  36.22 
 
 
313 aa  113  5e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  35.19 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  30.21 
 
 
314 aa  110  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  36.8 
 
 
290 aa  110  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  37.22 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  33.47 
 
 
291 aa  108  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  34.65 
 
 
337 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  34.13 
 
 
284 aa  105  9e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  35.14 
 
 
314 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  33.08 
 
 
292 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  35.27 
 
 
334 aa  99.8  5e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  28.19 
 
 
278 aa  98.2  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  32.46 
 
 
318 aa  95.1  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  31.37 
 
 
268 aa  93.2  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.8  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.8  8e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  31.5 
 
 
268 aa  92.4  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  33.55 
 
 
320 aa  92  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  29.25 
 
 
270 aa  91.7  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  31.1 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  31.1 
 
 
268 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  29.76 
 
 
262 aa  89.7  6e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  32.8 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  32.71 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  28.99 
 
 
301 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  32.42 
 
 
268 aa  87.4  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  30.53 
 
 
303 aa  87  4e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  33.2 
 
 
301 aa  85.1  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  29.1 
 
 
253 aa  84  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  28.33 
 
 
249 aa  82.8  0.000000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  27.08 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  28.63 
 
 
286 aa  79.3  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  25.66 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  26.62 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  26.62 
 
 
283 aa  70.1  0.00000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  24.11 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  26.81 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  27.31 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  28.4 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  25 
 
 
285 aa  65.9  0.0000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  28.34 
 
 
248 aa  63.5  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  27.59 
 
 
286 aa  57  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  24 
 
 
282 aa  49.7  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  39.47 
 
 
183 aa  49.3  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  23.14 
 
 
278 aa  44.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  51.22 
 
 
297 aa  43.9  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  22.22 
 
 
289 aa  42.4  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>