94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04844 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  608  1e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  90.78 
 
 
293 aa  544  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  77.89 
 
 
308 aa  467  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  68.75 
 
 
306 aa  421  1e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  69.08 
 
 
304 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  67.76 
 
 
304 aa  410  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  68.42 
 
 
304 aa  412  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  68.42 
 
 
304 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  67.76 
 
 
304 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  68.42 
 
 
304 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  68.09 
 
 
304 aa  412  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  67.43 
 
 
304 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  66.12 
 
 
315 aa  404  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  66.12 
 
 
316 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  66.67 
 
 
309 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  64.47 
 
 
310 aa  397  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  65.57 
 
 
311 aa  388  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  64.14 
 
 
307 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  64.26 
 
 
305 aa  387  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  66.44 
 
 
292 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  56.77 
 
 
312 aa  325  8.000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  51.37 
 
 
329 aa  292  6e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  48.66 
 
 
309 aa  285  8e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  48.46 
 
 
294 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  44.52 
 
 
332 aa  258  9e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  46.2 
 
 
307 aa  256  4e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  44.74 
 
 
314 aa  246  2e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  43.54 
 
 
313 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  45.42 
 
 
309 aa  228  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  43.04 
 
 
316 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  44.26 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  40.59 
 
 
324 aa  207  3e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  43.08 
 
 
341 aa  205  9e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  40.77 
 
 
294 aa  203  4e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  47.77 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  44.44 
 
 
330 aa  201  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  43.68 
 
 
330 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  38.91 
 
 
291 aa  189  5e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  42.51 
 
 
284 aa  169  5e-41  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  38.66 
 
 
292 aa  160  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  37.65 
 
 
301 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  36.25 
 
 
320 aa  150  4e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  30.03 
 
 
342 aa  149  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  37.4 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  36.12 
 
 
308 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  35.55 
 
 
314 aa  139  4.999999999999999e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  37.04 
 
 
290 aa  139  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  35.23 
 
 
305 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  31.44 
 
 
565 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  32.58 
 
 
337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  34.87 
 
 
278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  32.14 
 
 
319 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  31.23 
 
 
334 aa  120  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  36.03 
 
 
268 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  32.14 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  35.46 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  35.46 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  32.38 
 
 
318 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  35.06 
 
 
268 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  32.35 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  31.96 
 
 
303 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  33.33 
 
 
286 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  35.22 
 
 
268 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  31.72 
 
 
301 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  33.07 
 
 
355 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  32.77 
 
 
253 aa  106  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  33.06 
 
 
249 aa  105  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  35.68 
 
 
316 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  29.89 
 
 
320 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  33.85 
 
 
279 aa  97.8  2e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  31.97 
 
 
301 aa  96.3  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  34.44 
 
 
286 aa  95.9  8e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  30.77 
 
 
283 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  31.89 
 
 
283 aa  94  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  26.98 
 
 
286 aa  91.7  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  28.85 
 
 
285 aa  89.7  5e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  29.39 
 
 
253 aa  85.9  8e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  30.89 
 
 
282 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  27.94 
 
 
293 aa  82  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  29.13 
 
 
270 aa  73.9  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  30.32 
 
 
285 aa  67.8  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  27.92 
 
 
278 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  28.05 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  32.69 
 
 
183 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  28.46 
 
 
297 aa  63.9  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  25.1 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  23.64 
 
 
301 aa  47.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>