94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3022 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  608  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  56.77 
 
 		 305 aa  333  1e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  56.03 
 
 		 316 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  57.44 
 
 		 293 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  56.07 
 
 		 307 aa  316  4e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  53.8 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  55.12 
 
 		 310 aa  315  7e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  57.82 
 
 		 306 aa  312  3.9999999999999997e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  57.51 
 
 		 308 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  53.27 
 
 		 309 aa  301  1e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  53.14 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  52.81 
 
 		 304 aa  299  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  53.14 
 
 		 304 aa  300  3e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  52.81 
 
 		 304 aa  297  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  54.3 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  52.81 
 
 		 304 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  53.36 
 
 		 305 aa  295  6e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  51.95 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  52.15 
 
 		 304 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  52.15 
 
 		 304 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  52.15 
 
 		 304 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  52.4 
 
 		 292 aa  281  1e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  49.68 
 
 		 309 aa  280  3e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  47.13 
 
 		 332 aa  275  5e-73  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  47.42 
 
 		 307 aa  272  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  48.86 
 
 		 314 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  50 
 
 		 294 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  49.49 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  46.15 
 
 		 317 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  47.81 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  43.92 
 
 		 313 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  43.73 
 
 		 309 aa  235  8e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  49.62 
 
 		 294 aa  234  1.0000000000000001e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  47.68 
 
 		 337 aa  230  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  50.19 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  46.18 
 
 		 330 aa  210  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  46.82 
 
 		 330 aa  209  4e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  41.1 
 
 		 291 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  41.9 
 
 		 284 aa  186  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  39.58 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  41.63 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  41.84 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  43.32 
 
 		 297 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  31.27 
 
 		 342 aa  159  8e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  38.75 
 
 		 305 aa  152  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  39.48 
 
 		 308 aa  150  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  37.09 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  35 
 
 		 337 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  36.18 
 
 		 320 aa  135  9e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  34.55 
 
 		 278 aa  132  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  37.3 
 
 		 319 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  38.58 
 
 		 565 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  35.27 
 
 		 318 aa  126  4.0000000000000003e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  126  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  33.59 
 
 		 268 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  33.87 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  37.65 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 262 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  33.47 
 
 		 268 aa  122  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  34.19 
 
 		 253 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  31.47 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  39.11 
 
 		 316 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  32.95 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  31.86 
 
 		 301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  31.27 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  34.02 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  32.29 
 
 		 286 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  32.55 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  32.55 
 
 		 283 aa  106  4e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  34.35 
 
 		 355 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  33.2 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  30.17 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  28.81 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  35.91 
 
 		 301 aa  95.9  8e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  29.64 
 
 		 285 aa  95.9  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  30.49 
 
 		 286 aa  95.5  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  30.43 
 
 		 279 aa  93.2  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  31.89 
 
 		 283 aa  92.8  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  32.13 
 
 		 285 aa  90.5  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  27.31 
 
 		 293 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  28.74 
 
 		 248 aa  77.8  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  27.16 
 
 		 282 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  25.1 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  29.96 
 
 		 297 aa  72  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  28.86 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  32.79 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  22.99 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  25.98 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>