92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_2796 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  99.34 
 
 		 304 aa  597  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  99.67 
 
 		 304 aa  597  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  599  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  94.74 
 
 		 304 aa  577  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  93.42 
 
 		 304 aa  574  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  93.42 
 
 		 304 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  93.42 
 
 		 304 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  93.09 
 
 		 304 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  93.49 
 
 		 292 aa  548  1e-155  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  75.5 
 
 		 316 aa  457  9.999999999999999e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  74.59 
 
 		 311 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  72.37 
 
 		 310 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  72.04 
 
 		 315 aa  449  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  70.67 
 
 		 309 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  72.19 
 
 		 307 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  70.3 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  68.42 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  66.1 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  65.68 
 
 		 308 aa  378  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  62.59 
 
 		 306 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  53.14 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  48.85 
 
 		 309 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  48.28 
 
 		 294 aa  271  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  45.79 
 
 		 329 aa  256  4e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  43.28 
 
 		 332 aa  246  4e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  44.37 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  45.77 
 
 		 309 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  42.32 
 
 		 313 aa  223  3e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  42.9 
 
 		 307 aa  222  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  42.57 
 
 		 316 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  44.52 
 
 		 317 aa  216  5e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  42.72 
 
 		 324 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  41.39 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  41.33 
 
 		 294 aa  198  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  47.35 
 
 		 337 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  41.67 
 
 		 330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  42.91 
 
 		 330 aa  195  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  41.1 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  39.42 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  41.98 
 
 		 297 aa  159  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  39.84 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  36.84 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  29.91 
 
 		 342 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  37.86 
 
 		 290 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  35.1 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  31.88 
 
 		 565 aa  125  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  34.77 
 
 		 314 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  34.88 
 
 		 305 aa  122  7e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  32.57 
 
 		 308 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  35.52 
 
 		 355 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  31.42 
 
 		 337 aa  115  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  33.47 
 
 		 262 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  34.04 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  30.89 
 
 		 268 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  33.6 
 
 		 319 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  30.49 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  30.49 
 
 		 268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  30.08 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  29.02 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  33.07 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  32.55 
 
 		 309 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  29.33 
 
 		 318 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  36.63 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  30.74 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  28.86 
 
 		 268 aa  96.3  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  30.04 
 
 		 279 aa  95.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  29.96 
 
 		 286 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  31.52 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  31.52 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  30.38 
 
 		 301 aa  94.7  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  30.27 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  34.04 
 
 		 286 aa  89.7  5e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  29.81 
 
 		 320 aa  87.4  3e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  29.6 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  28.97 
 
 		 286 aa  86.3  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  32.39 
 
 		 283 aa  85.5  9e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  27.64 
 
 		 248 aa  81.6  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  31.82 
 
 		 301 aa  78.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  29.22 
 
 		 282 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  32.69 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  29.22 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  34.75 
 
 		 183 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  26.22 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  29.41 
 
 		 285 aa  63.2  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  25.48 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  24.79 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>