125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1936 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  100 
 
 		 565 aa  1108    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  35.69 
 
 		 316 aa  176  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  39.71 
 
 		 309 aa  168  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  36.36 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  37.2 
 
 		 341 aa  162  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  38.46 
 
 		 330 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  36.79 
 
 		 330 aa  161  3e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  33.66 
 
 		 324 aa  161  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  35.5 
 
 		 314 aa  160  5e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  36.67 
 
 		 294 aa  159  2e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  39.33 
 
 		 309 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  35.33 
 
 		 317 aa  157  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  39.92 
 
 		 294 aa  154  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  33.01 
 
 		 305 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  35.77 
 
 		 308 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  35.04 
 
 		 313 aa  146  8.000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  35.77 
 
 		 306 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  35.95 
 
 		 332 aa  144  6e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  38.58 
 
 		 312 aa  143  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  35.34 
 
 		 316 aa  139  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  36.25 
 
 		 310 aa  139  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  36.9 
 
 		 297 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  32.11 
 
 		 307 aa  136  9e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  31.44 
 
 		 305 aa  136  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  32.67 
 
 		 309 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  34.58 
 
 		 315 aa  131  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  31.08 
 
 		 293 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  35.98 
 
 		 304 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  35.98 
 
 		 304 aa  130  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  31.88 
 
 		 304 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  33.74 
 
 		 284 aa  128  3e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  35.98 
 
 		 304 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  30.19 
 
 		 342 aa  127  7e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  36.4 
 
 		 304 aa  126  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  35.98 
 
 		 304 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  34.73 
 
 		 292 aa  125  2e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  34.55 
 
 		 307 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  35.98 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  34.21 
 
 		 304 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  35.47 
 
 		 292 aa  124  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  36.4 
 
 		 290 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  37.61 
 
 		 291 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  37.55 
 
 		 301 aa  121  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  32.93 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  32.41 
 
 		 329 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  34.38 
 
 		 268 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  8.999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  34.38 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  34.38 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  34.52 
 
 		 268 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  35.91 
 
 		 305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  35.23 
 
 		 308 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  32.65 
 
 		 278 aa  108  3e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  34.62 
 
 		 268 aa  107  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  40.72 
 
 		 318 aa  105  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  28.3 
 
 		 286 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  32.44 
 
 		 314 aa  103  8e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  37.44 
 
 		 334 aa  101  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  30.92 
 
 		 320 aa  100  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  34.82 
 
 		 316 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  31.89 
 
 		 319 aa  99  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  33.46 
 
 		 283 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  33.46 
 
 		 283 aa  98.6  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  31.01 
 
 		 309 aa  97.4  6e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  36.95 
 
 		 320 aa  96.7  9e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  29.58 
 
 		 337 aa  91.7  3e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 286 aa  89.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  28.29 
 
 		 355 aa  89  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  30.83 
 
 		 262 aa  87.8  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  28.16 
 
 		 249 aa  87.4  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  30.96 
 
 		 253 aa  85.5  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  30.71 
 
 		 301 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  30.71 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  28.69 
 
 		 270 aa  82.4  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  31.42 
 
 		 279 aa  82  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  26.42 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  27.21 
 
 		 293 aa  80.9  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  28.17 
 
 		 285 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  29.03 
 
 		 282 aa  78.6  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  30.19 
 
 		 286 aa  78.6  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  30.61 
 
 		 253 aa  75.9  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  31.17 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  28.04 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  28.64 
 
 		 285 aa  65.9  0.000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0187  protein of unknown function DUF368  20.95 
 
 		 289 aa  58.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0266  hypothetical protein  29.75 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.309104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.79 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  24 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  24 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  24 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0251  hypothetical protein  28.4 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0366  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.76 
 
 		 264 aa  57  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4961  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.94 
 
 		 264 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000885099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  23.35 
 
 		 248 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  23.35 
 
 		 248 aa  56.6  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>