32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0251 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0251  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0165196 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0266  phosphoesterase, PA-phosphatase related  98.48 
 
 
264 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0276  phosphoesterase PA-phosphatase related  91.29 
 
 
264 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.379277  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4961  phosphoesterase PA-phosphatase related  86.74 
 
 
264 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000885099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0266  hypothetical protein  67.3 
 
 
266 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.309104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68620  hypothetical protein  59.47 
 
 
267 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5938  hypothetical protein  59.47 
 
 
267 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0366  phosphoesterase, PA-phosphatase related  48.72 
 
 
264 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.62 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.797706  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1502  hypothetical protein  29.86 
 
 
233 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2706  PAP2 family protein  29.38 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2783  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.38 
 
 
233 aa  82.4  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1647  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.56 
 
 
233 aa  82  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.177932  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3242  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.28 
 
 
234 aa  82  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.012281 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.69 
 
 
236 aa  79  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2770  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.55 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.162621  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02104  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.11 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02063  hypothetical protein  28.11 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1473  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.11 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000602419  hitchhiker  0.00323663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2312  PAP2 family protein  28.11 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.503655  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2334  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.22 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2323  PAP2 family protein  27.65 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.00704266 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1483  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  27.65 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.427911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0784  PAP2 family protein  27.65 
 
 
249 aa  70.5  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.248881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3312  PAP2 family protein  27.65 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0314391  normal  0.0360281 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2472  PAP2 family protein  27.65 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.117314  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  27.98 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  27.98 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  27.98 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  29.49 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  29.49 
 
 
248 aa  69.3  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  28.14 
 
 
565 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.288941 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>