94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0156 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0156  protein of unknown function DUF368  100 
 
 		 297 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3873  hypothetical protein  45.88 
 
 		 330 aa  186  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0387  protein of unknown function DUF368  40.21 
 
 		 320 aa  182  9.000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2007  hypothetical protein  44.06 
 
 		 337 aa  176  3e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00601803  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24370  predicted membrane protein  44.49 
 
 		 355 aa  175  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0943  hypothetical protein  43.73 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0196129  normal  0.291666 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1858  hypothetical protein  37.92 
 
 		 341 aa  172  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685833 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20100  predicted membrane protein  41.31 
 
 		 337 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00191645  normal  0.0169787 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2147  hypothetical protein  38.64 
 
 		 294 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0149  protein of unknown function DUF368  40.46 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1306  hypothetical protein  43.67 
 
 		 309 aa  169  4e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0094  hypothetical protein  39.52 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000305828  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2001  hypothetical protein  36.82 
 
 		 324 aa  165  6.9999999999999995e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651043 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3022  hypothetical protein  39.81 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013272 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2783  hypothetical protein  44.18 
 
 		 307 aa  163  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3073  hypothetical protein  41.94 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0036  membrane protein  37.31 
 
 		 306 aa  162  6e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2249  hypothetical protein  43.26 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3225  hypothetical protein  41.94 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3082  hypothetical protein  41.94 
 
 		 304 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3862  hypothetical protein  40 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.887311  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1294  protein of unknown function DUF368  41.94 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1811  protein of unknown function DUF368  38.19 
 
 		 317 aa  160  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0703  protein of unknown function DUF368  39 
 
 		 316 aa  160  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.339954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2796  hypothetical protein  41.98 
 
 		 304 aa  159  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0809  hypothetical protein  36.11 
 
 		 284 aa  158  8e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0473658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1206  hypothetical protein  42.8 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2975  hypothetical protein  41.56 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2879  hypothetical protein  41.56 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0930  hypothetical protein  41.46 
 
 		 305 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0607  protein of unknown function DUF368  41.13 
 
 		 309 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0928  hypothetical protein  42.97 
 
 		 329 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06740  integral membrane protein  35.55 
 
 		 307 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1400  hypothetical protein  45.34 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1640  hypothetical protein  40.43 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.849383 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001101  membrane protein  39.92 
 
 		 293 aa  150  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2840  hypothetical protein  42.56 
 
 		 311 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0693  hypothetical protein  41.32 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0960  hypothetical protein  40.5 
 
 		 316 aa  149  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1107  hypothetical protein  37.86 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04844  hypothetical protein  37.4 
 
 		 305 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0446  hypothetical protein  36.4 
 
 		 292 aa  145  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2633  hypothetical protein  39.62 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1038  hypothetical protein  37.45 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.246357  normal  0.714763 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0704  hypothetical protein  39.32 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.527193  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3040  hypothetical protein  38.43 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1251  membrane protein  36.25 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1061  protein of unknown function DUF368  38.97 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1921  protein of unknown function DUF368  39.42 
 
 		 301 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1936  hypothetical protein  35.06 
 
 		 565 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288941 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0288  protein of unknown function DUF368  36.53 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5992  protein of unknown function DUF368  42.28 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1638  hypothetical protein  33.2 
 
 		 278 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5276  hypothetical protein  33.07 
 
 		 268 aa  116  5e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.348652  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4950  hypothetical protein  33.07 
 
 		 268 aa  115  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5681  hypothetical protein  33.07 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2958  protein of unknown function DUF368  37.36 
 
 		 308 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4850  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5261  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5006  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4835  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5242  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5318  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5386  hypothetical protein  32.68 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3700  hypothetical protein  32.04 
 
 		 268 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.435623  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06735  Predicted membrane protein  30.55 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.260385  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0858  hypothetical protein  29.34 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00296039  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0842  hypothetical protein  29.34 
 
 		 283 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0142899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0838  hypothetical protein  28.28 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2809  protein of unknown function DUF368  33.2 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0495  hypothetical protein  30.27 
 
 		 286 aa  99.4  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.322978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3492  hypothetical protein  24.91 
 
 		 293 aa  94  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0279106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0784  hypothetical protein  26.36 
 
 		 262 aa  93.2  5e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0644  hypothetical protein  24.15 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0540677  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2250  hypothetical protein  28.85 
 
 		 253 aa  92  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1370  hypothetical protein  27.16 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1029  hypothetical protein  26.04 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1628  hypothetical protein  27.16 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0717  hypothetical protein  28.35 
 
 		 282 aa  89.7  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.18913  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0888  protein of unknown function DUF368  25.1 
 
 		 286 aa  89  8e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3629  protein of unknown function DUF368  33.7 
 
 		 318 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0761  hypothetical protein  26.18 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2510  hypothetical protein  25.77 
 
 		 285 aa  88.2  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000712046  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2829  protein of unknown function DUF368  31.82 
 
 		 320 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2358  protein of unknown function DUF368  25.74 
 
 		 286 aa  78.2  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000115253  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0787  hypothetical protein  24.12 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1575  protein of unknown function DUF368  24.02 
 
 		 270 aa  72  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1718  hypothetical protein  33.21 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1472  hypothetical protein  26.97 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.248471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2501  protein of unknown function DUF368  42.55 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2720  membrane protein-like protein  32.2 
 
 		 183 aa  65.1  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1873  protein of unknown function DUF368  27.05 
 
 		 248 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000015734  normal  0.185008 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1510  protein of unknown function DUF368  24.6 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1385  transporter, hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family  27.35 
 
 		 1050 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.252885 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>