More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0500 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0500  nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 		 246 aa  513  1e-144  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1527  nucleoside-diphosphate kinase  38.65 
 
 		 148 aa  104  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000566951  unclonable  1.91396e-19 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  38.04 
 
 		 150 aa  104  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2624  nucleoside diphosphate kinase  36.09 
 
 		 155 aa  102  4e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.566963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  34.97 
 
 		 149 aa  101  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  35.58 
 
 		 149 aa  99.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  34.36 
 
 		 149 aa  98.6  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  33.13 
 
 		 149 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  33.13 
 
 		 149 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  35.44 
 
 		 149 aa  96.7  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  35.44 
 
 		 152 aa  96.7  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  36.42 
 
 		 154 aa  95.9  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  36.88 
 
 		 136 aa  95.5  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  32.56 
 
 		 149 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  37.2 
 
 		 149 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  37.2 
 
 		 149 aa  95.5  7e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  34.97 
 
 		 149 aa  95.1  1e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  37.58 
 
 		 149 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  37.58 
 
 		 149 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  34.36 
 
 		 149 aa  94.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  37.58 
 
 		 149 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  35.03 
 
 		 138 aa  93.6  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  35.67 
 
 		 136 aa  93.2  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  34.12 
 
 		 151 aa  93.2  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  39.38 
 
 		 145 aa  92.4  6e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  35.67 
 
 		 136 aa  92  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  34.36 
 
 		 149 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  32.93 
 
 		 138 aa  91.3  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  33.74 
 
 		 149 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  35.03 
 
 		 136 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2227  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 		 143 aa  91.7  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  35.67 
 
 		 136 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  36.08 
 
 		 133 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1939  nucleoside diphosphate kinase  34.81 
 
 		 143 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  33.52 
 
 		 149 aa  90.9  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  33.33 
 
 		 138 aa  90.1  3e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  33.54 
 
 		 159 aa  90.1  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  33.33 
 
 		 151 aa  89.7  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  33.13 
 
 		 149 aa  90.1  3e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  33.74 
 
 		 149 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  35.58 
 
 		 151 aa  89.7  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  32.52 
 
 		 153 aa  89.4  5e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  32.78 
 
 		 149 aa  89  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2395  nucleoside diphosphate kinase  37.27 
 
 		 139 aa  88.6  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0825331  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  37.97 
 
 		 137 aa  89  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  33.54 
 
 		 139 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  34.12 
 
 		 160 aa  87.8  1e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  32.32 
 
 		 151 aa  88.2  1e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  35.26 
 
 		 140 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  31.1 
 
 		 138 aa  88.2  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  33.74 
 
 		 131 aa  87.4  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  30.49 
 
 		 166 aa  87  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  31.9 
 
 		 139 aa  87.8  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  87  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  34.16 
 
 		 136 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  32.1 
 
 		 140 aa  86.3  4e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  32.52 
 
 		 152 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  34.39 
 
 		 143 aa  86.3  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  39.24 
 
 		 140 aa  85.9  5e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  33.54 
 
 		 135 aa  85.5  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  35.67 
 
 		 143 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.5  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.5  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  31.1 
 
 		 148 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  37.74 
 
 		 143 aa  85.1  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  34.39 
 
 		 136 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  32.52 
 
 		 149 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  30.49 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  31.9 
 
 		 149 aa  84  0.000000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  32.92 
 
 		 136 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  33.33 
 
 		 135 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  32.72 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1295  nucleoside diphosphate kinase  31.87 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2524  Nucleoside-diphosphate kinase  33.13 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  34.97 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1342  nucleoside diphosphate kinase  31.71 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00960069  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0454  Nucleoside-diphosphate kinase  33.54 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  30.86 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1571  nucleoside diphosphate kinase  32.28 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  33.33 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  30.67 
 
 		 152 aa  81.3  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  33.33 
 
 		 148 aa  81.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  31.95 
 
 		 149 aa  81.3  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1402  nucleoside diphosphate kinase  31.29 
 
 		 144 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000394217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01364  nucleoside diphosphate kinase  31.55 
 
 		 143 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  32.35 
 
 		 150 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  32.5 
 
 		 139 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.691191 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0619  nucleoside-diphosphate kinase  33.54 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000154193  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1580  Nucleoside-diphosphate kinase  31.74 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.486326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0381  nucleoside-diphosphate kinase  33.13 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  32.48 
 
 		 137 aa  79.7  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  32.7 
 
 		 151 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  33.76 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  30.86 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  31.45 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>