More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1580 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_1580  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
151 aa  308  1e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.486326  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2667  nucleoside-diphosphate kinase  53.9 
 
 
138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456959  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  42.66 
 
 
154 aa  128  3e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  45 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  43.45 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  45.07 
 
 
149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 
149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
149 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 
148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 
148 aa  123  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 
148 aa  123  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  42.25 
 
 
148 aa  123  7e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
148 aa  122  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
166 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0772  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 
149 aa  122  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.673527 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 
151 aa  120  7e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0716  nucleoside diphosphate kinase  42.34 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000381443  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  41.55 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  40.14 
 
 
149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  41.43 
 
 
149 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  40.71 
 
 
149 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  39.29 
 
 
149 aa  118  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  40 
 
 
149 aa  116  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 
149 aa  116  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  37.93 
 
 
152 aa  116  9e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2814  nucleoside diphosphate kinase  43.15 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0929  nucleoside diphosphate kinase  42.55 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108776  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1845  nucleoside diphosphate kinase  40.41 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00368258  normal  0.19562 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  39.29 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1929  nucleoside diphosphate kinase  41.84 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  40.85 
 
 
151 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1601  nucleoside diphosphate kinase  41.84 
 
 
141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.144621 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  40.71 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2090  nucleoside diphosphate kinase  43.7 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  39.86 
 
 
150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1352  nucleoside-diphosphate kinase  43.7 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378261  unclonable  0.00000000000374498 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1775  nucleoside-diphosphate kinase  42.14 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  43.07 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1334  nucleoside diphosphate kinase  42.14 
 
 
137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2188  nucleoside diphosphate kinase  39.26 
 
 
143 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  40.74 
 
 
131 aa  111  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0753  nucleoside diphosphate kinase  39.04 
 
 
160 aa  111  3e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.293276  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  38.57 
 
 
149 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2890  Nucleoside-diphosphate kinase  39.29 
 
 
138 aa  111  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.421827  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1626  nucleoside diphosphate kinase  39.72 
 
 
137 aa  111  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0373  nucleoside diphosphate kinase  39.86 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178745  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  44.85 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2544  nucleoside diphosphate kinase  40.43 
 
 
141 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0478014  hitchhiker  0.00487946 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  40 
 
 
150 aa  110  5e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  39.44 
 
 
151 aa  110  6e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  39.26 
 
 
143 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  42.65 
 
 
136 aa  110  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  42.86 
 
 
151 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2110  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
141 aa  110  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.195535 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  38.73 
 
 
151 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  38.73 
 
 
217 aa  110  9e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0074  Nucleoside-diphosphate kinase  41.43 
 
 
138 aa  110  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2164  Nucleoside-diphosphate kinase  40.71 
 
 
139 aa  110  9e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.961833 
 
 
-
 
NC_002936  DET0394  nucleoside diphosphate kinase  38.03 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0606633  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  40.88 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2000  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.136751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1591  nucleoside diphosphate kinase  40.43 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  39.73 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_336  nucleoside diphosphate kinase  38.03 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000506445  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0225  Nucleoside-diphosphate kinase  40 
 
 
137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  37.76 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  38.57 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  38.03 
 
 
149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1726  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.204847 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0377  nucleoside diphosphate kinase  40 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40330  Nucleoside-diphosphate kinase  43.57 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0354  nucleoside diphosphate kinase  40 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.773452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2670  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.20658 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1460  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.425797  normal  0.366312 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6264  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1839  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.587203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1753  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1815  nucleoside diphosphate kinase  41.13 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2872  nucleoside-diphosphate kinase  42.22 
 
 
141 aa  108  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1624  nucleoside diphosphate kinase  40.43 
 
 
141 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.615734  hitchhiker  0.00226942 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  37.96 
 
 
143 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  42.22 
 
 
141 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0233  nucleoside diphosphate kinase  40 
 
 
137 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0202  nucleoside diphosphate kinase  37.16 
 
 
147 aa  108  3e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02410  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1150  Nucleoside-diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.306657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2893  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02372  hypothetical protein  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1159  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.695355  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2669  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3743  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3012  nucleoside diphosphate kinase  41.43 
 
 
143 aa  107  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>