More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0202 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0202  nucleoside diphosphate kinase  100 
 
 		 147 aa  303  7e-82  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1571  nucleoside diphosphate kinase  48.51 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  48.12 
 
 		 145 aa  141  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10080  nucleoside diphosphate kinase  48.51 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187538  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  48.55 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09920  nucleoside diphosphate kinase  50.36 
 
 		 141 aa  138  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  48.55 
 
 		 141 aa  136  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  48.51 
 
 		 137 aa  136  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  45.32 
 
 		 152 aa  136  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1461  Nucleoside-diphosphate kinase  44.53 
 
 		 144 aa  135  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0805889  normal  0.284135 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0929  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 142 aa  135  2e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.108776  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2395  nucleoside diphosphate kinase  48.51 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0825331  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  46.67 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0905  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 		 138 aa  132  9.999999999999999e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.244999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  48.55 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  45.99 
 
 		 143 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  50.74 
 
 		 136 aa  130  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  44.29 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  47.06 
 
 		 150 aa  129  9e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  45.99 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  45.52 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  41.61 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  49.26 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_42104  nucleoside diphosphate kinase 2  47.06 
 
 		 148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  43.06 
 
 		 153 aa  128  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0716  nucleoside diphosphate kinase  45.65 
 
 		 136 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000381443  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  47.79 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  45.77 
 
 		 151 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  44.29 
 
 		 147 aa  127  6e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  43.48 
 
 		 152 aa  127  7.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  47.01 
 
 		 149 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  40.43 
 
 		 141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  46.27 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  43.38 
 
 		 152 aa  124  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  43.97 
 
 		 148 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  43.8 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  45.39 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  44.85 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  43.8 
 
 		 136 aa  124  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 		 149 aa  124  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  44.53 
 
 		 149 aa  124  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  44.85 
 
 		 135 aa  123  7e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  44.03 
 
 		 139 aa  123  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  45.52 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  43.26 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0102  nucleoside diphosphate kinase  46.27 
 
 		 131 aa  123  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.874846  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  47.01 
 
 		 143 aa  122  1e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  44.53 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0034  nucleoside diphosphate kinase  42.66 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  43.88 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  43.26 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  46.72 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  43.26 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  42.45 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  45.32 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  43.26 
 
 		 154 aa  121  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  44.2 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  42.55 
 
 		 166 aa  120  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0222  nucleoside diphosphate kinase  43.57 
 
 		 149 aa  120  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000924412  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  43.8 
 
 		 217 aa  120  9e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1252  Nucleoside-diphosphate kinase  42.34 
 
 		 134 aa  120  9e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  43.07 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 		 137 aa  119  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  42.36 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2512  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 		 151 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.112534  normal  0.633547 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  45.93 
 
 		 149 aa  118  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  42.96 
 
 		 140 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  42.25 
 
 		 149 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  44.78 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  44.03 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0029  nucleoside diphosphate kinase  40.43 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093347 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  45.26 
 
 		 149 aa  117  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  43.07 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  42.22 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1379  nucleoside diphosphate kinase  42.96 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00601  nucleoside diphosphate kinase  43.66 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.344032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  40.74 
 
 		 137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26635  predicted protein  44.19 
 
 		 144 aa  114  3e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1604  nucleoside diphosphate kinase  44.03 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  41.91 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  41.91 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09200  nucleoside diphosphate kinase  44.12 
 
 		 135 aa  115  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.397832  normal  0.262765 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06060  nucleoside diphosphate kinase  40.15 
 
 		 134 aa  114  5e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.678172  hitchhiker  0.00000000266353 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  38.46 
 
 		 149 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  45.52 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  44.44 
 
 		 152 aa  113  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2870  Nucleoside-diphosphate kinase  44.62 
 
 		 143 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01064  nucleoside diphosphate kinase  43.88 
 
 		 141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2171  nucleoside diphosphate kinase  42.25 
 
 		 151 aa  113  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>