More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1158 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_1158  Nucleoside-diphosphate kinase  100 
 
 
151 aa  307  4e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3490  Nucleoside-diphosphate kinase  74.65 
 
 
143 aa  219  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.526204  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1461  Nucleoside-diphosphate kinase  73.43 
 
 
144 aa  214  2e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0805889  normal  0.284135 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23840  nucleoside diphosphate kinase  73.05 
 
 
145 aa  214  4e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.882593  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09190  nucleoside diphosphate kinase  64.43 
 
 
152 aa  199  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.513672 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0976  Nucleoside-diphosphate kinase  67.15 
 
 
147 aa  196  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.954485  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2149  Nucleoside-diphosphate kinase  66.18 
 
 
137 aa  194  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2395  nucleoside diphosphate kinase  65.44 
 
 
139 aa  193  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0825331  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2558  Nucleoside-diphosphate kinase  64.03 
 
 
140 aa  188  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.927598  normal  0.152137 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09920  nucleoside diphosphate kinase  60.43 
 
 
141 aa  170  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208404  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10080  nucleoside diphosphate kinase  58.21 
 
 
140 aa  168  3e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.187538  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1584  Nucleoside-diphosphate kinase  61.27 
 
 
140 aa  163  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1571  nucleoside diphosphate kinase  54.81 
 
 
137 aa  163  9e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2469  nucleoside-diphosphate kinase  58.52 
 
 
136 aa  160  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.581483 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1471  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 
136 aa  159  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0389598  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3466  nucleoside diphosphate kinase  58.09 
 
 
135 aa  155  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1498  Nucleoside-diphosphate kinase  59.42 
 
 
136 aa  155  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00169292  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12410  nucleoside diphosphate kinase  58.7 
 
 
136 aa  155  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.26878 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2188  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
135 aa  154  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1538  Nucleoside-diphosphate kinase  56.2 
 
 
136 aa  154  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.01886  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1172  Nucleoside-diphosphate kinase  58.7 
 
 
136 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3389  Nucleoside-diphosphate kinase  56.52 
 
 
134 aa  152  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1210  nucleoside diphosphate kinase  57.55 
 
 
137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2057  Nucleoside-diphosphate kinase  57.25 
 
 
138 aa  150  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3948  nucleoside diphosphate kinase  55.88 
 
 
136 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.71627  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2228  nucleoside diphosphate kinase  55.07 
 
 
135 aa  149  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0390683  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5270  nucleoside diphosphate kinase  54.68 
 
 
137 aa  148  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344371  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2633  nucleoside diphosphate kinase  55.8 
 
 
136 aa  148  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0272409  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0106  nucleoside diphosphate kinase  53.33 
 
 
139 aa  147  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0501488  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7283  Nucleoside-diphosphate kinase  55.56 
 
 
136 aa  146  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.260175  normal  0.359309 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0747  nucleoside diphosphate kinase  56.52 
 
 
141 aa  146  9e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.23703  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3552  nucleoside diphosphate kinase  54 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.54006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3625  nucleoside diphosphate kinase  54 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.978104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3557  nucleoside diphosphate kinase  54 
 
 
149 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.252245  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12472  nucleoside diphosphate kinase  53.68 
 
 
136 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222546  normal  0.621112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1689  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 
149 aa  143  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0684  Nucleoside-diphosphate kinase  54.07 
 
 
135 aa  143  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.33705  normal  0.254357 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2058  Nucleoside-diphosphate kinase  49.63 
 
 
149 aa  139  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0127  Nucleoside-diphosphate kinase  49.63 
 
 
138 aa  138  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0773587  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0471  nucleoside diphosphate kinase  48.53 
 
 
149 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1642  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 
148 aa  137  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.134451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3912  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 
149 aa  137  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.54427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2986  Nucleoside-diphosphate kinase  51.47 
 
 
138 aa  137  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.635873  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0905  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 
138 aa  135  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.244999  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3424  nucleoside diphosphate kinase  46.67 
 
 
149 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3489  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 
141 aa  136  1e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.235797  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1571  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 
148 aa  136  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2148  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 
149 aa  135  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110193  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3774  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 
148 aa  136  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0937867  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1425  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1397  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1397  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.769296  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1609  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0015371 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0230  Nucleoside-diphosphate kinase  48.89 
 
 
149 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1691  Nucleoside-diphosphate kinase  48.23 
 
 
152 aa  135  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1678  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0279521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1536  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.744838  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1238  nucleoside diphosphate kinase  48.18 
 
 
148 aa  135  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.182148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0146  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 
149 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.129739  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2497  nucleoside diphosphate kinase  49.26 
 
 
151 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0537474  hitchhiker  0.0011549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3868  nucleoside diphosphate kinase  51.09 
 
 
141 aa  134  4e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.211598  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1239  Nucleoside-diphosphate kinase  49.25 
 
 
148 aa  134  4e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0127  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 
149 aa  133  7.000000000000001e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00040387  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1439  nucleoside diphosphate kinase  47.45 
 
 
166 aa  133  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0088  nucleoside-diphosphate kinase  52.59 
 
 
150 aa  133  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2031  Nucleoside-diphosphate kinase  49.25 
 
 
154 aa  133  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00000421495  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0334  nucleoside-diphosphate kinase  50.39 
 
 
143 aa  132  9.999999999999999e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_41676  nucleoside diphosphate kinase 1  47.76 
 
 
152 aa  133  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.101796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1845  nucleoside-diphosphate kinase  47.41 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67856  nucleoside diphosphate kinase  47.79 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.194795  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1500  nucleoside diphosphate kinase  47.41 
 
 
149 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.184846 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1037  nucleoside diphosphate kinase  45.19 
 
 
149 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.195932  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2250  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 
149 aa  131  3e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0731534  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2656  Nucleoside-diphosphate kinase  49.28 
 
 
135 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.412174  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3385  nucleoside diphosphate kinase  46.67 
 
 
149 aa  130  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000000364123  normal  0.0624984 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1390  nucleoside diphosphate kinase  48.91 
 
 
139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1526  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.112501  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1532  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.412511  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1556  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0202  nucleoside diphosphate kinase  41.61 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0907  nucleoside-diphosphate kinase  44.78 
 
 
148 aa  128  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1382  Nucleoside-diphosphate kinase  49.63 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0526  nucleoside diphosphate kinase  45.59 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.535144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4224  nucleoside diphosphate kinase  45.19 
 
 
149 aa  128  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00531  nucleoside diphosphate kinase  48.51 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1286  nucleoside diphosphate kinase  48.15 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.691191 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08216  Nucleoside diphosphate kinase (NDP kinase)(EC 2.7.4.6)(AnNDK)(NDK) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8TFN0]  47.06 
 
 
153 aa  128  3e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0828152  normal  0.568848 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004352  nucleoside diphosphate kinase  45.99 
 
 
141 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0725  nucleoside diphosphate kinase  47.06 
 
 
144 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1141  nucleoside diphosphate kinase  44.53 
 
 
149 aa  128  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.493894  hitchhiker  0.00547738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1207  Nucleoside-diphosphate kinase  43.38 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169268  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3326  nucleoside-diphosphate kinase  46.67 
 
 
144 aa  127  4.0000000000000003e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27292  predicted protein  45.59 
 
 
150 aa  127  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0765  Nucleoside-diphosphate kinase  49.64 
 
 
136 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28301  nucleoside diphosphate kinase  49.63 
 
 
152 aa  127  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.15425 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_25127  nucleoside diphosphate kinase 3  44.44 
 
 
217 aa  127  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.439497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1605  nucleoside diphosphate kinase  46.27 
 
 
139 aa  127  8.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00669649  unclonable  1.1909600000000001e-23 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1181  Nucleoside-diphosphate kinase  45.19 
 
 
150 aa  126  8.000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850843  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02610  nucleoside-diphosphate kinase, putative  44.2 
 
 
152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0716  nucleoside diphosphate kinase  40.58 
 
 
136 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000381443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>