79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4660 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4660  putative GerE family regulatory protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.943162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4569  putative GerE family regulatory protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0855442  normal  0.34039 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4575  putative GerE family regulatory protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4709  putative GerE family regulatory protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.215076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4660  putative GerE family regulatory protein  100 
 
 		 90 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 226 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  40 
 
 		 212 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 212 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 232 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 232 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  39.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 203 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  38.46 
 
 		 211 aa  44.3  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 238 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 229 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0272  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 244 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.264008  normal  0.348846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  44.44 
 
 		 265 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  44.44 
 
 		 234 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.51 
 
 		 229 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 224 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.82 
 
 		 208 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 235 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4911  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4598  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000019366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4959  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140548  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3690  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0223527  decreased coverage  0.00000764296 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0523  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 240 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335975  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5878  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04208  hypothetical protein  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0122864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 215 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3632  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000755622  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04242  predicted DNA-binding transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00962372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 241 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0475  regulatory protein LuxR  30.19 
 
 		 271 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4627  two component LuxR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 216 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.527017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 217 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 225 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0072  transcriptional regulator, LuxR family  30.99 
 
 		 477 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.323936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.31 
 
 		 214 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 219 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4907  transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 244 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000001744  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3227  LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 545 aa  40.8  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  36.54 
 
 		 231 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  33.33 
 
 		 220 aa  40.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40.4  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  34.55 
 
 		 220 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3079  two component LuxR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 233 aa  40  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  40  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 218 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  38.46 
 
 		 214 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  34.55 
 
 		 220 aa  40  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  37.74 
 
 		 216 aa  40  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>