109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3188 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3328  transmembrane pair domain-containing protein  98.97 
 
 		 144 aa  203  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1184  transmembrane pair domain protein  98.97 
 
 		 144 aa  203  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3184  transmembrane pair domain-containing protein  97.94 
 
 		 144 aa  202  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3188  transmembrane pair domain-containing protein  100 
 
 		 97 aa  201  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01850  hypothetical protein  67.06 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003832  hypothetical protein  58.76 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1343  transmembrane pair domain-containing protein  57.14 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00249061  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1150  transmembrane pair domain-containing protein  55 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0722868 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0422  hypothetical protein  52.33 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1137  transmembrane pair domain-containing protein  62.65 
 
 		 137 aa  99  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1826  transmembrane pair domain-containing protein  42.86 
 
 		 141 aa  96.7  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1243  hypothetical protein  57.14 
 
 		 136 aa  92.8  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.548617 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3743  hypothetical protein  48.75 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0789  transmembrane pair domain protein  42.17 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3190  transmembrane pair domain protein  45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3253  transmembrane pair domain protein  45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0302797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3239  transmembrane pair domain-containing protein  45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.722595  hitchhiker  0.00127863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3173  transmembrane pair domain protein  45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3354  transmembrane pair domain-containing protein  45 
 
 		 151 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1025  transmembrane pair domain protein  42.17 
 
 		 156 aa  77  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0461  membrane protein  46.99 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4391  transmembrane pair domain-containing protein  40 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.52144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3301  transmembrane pair domain-containing protein  43.37 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5096  transmembrane pair domain protein  36.73 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1165  transmembrane pair domain protein  37.11 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3338  transmembrane pair domain-containing protein  35.29 
 
 		 141 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5841  transmembrane pair domain-containing protein  36.08 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000571539 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3587  transmembrane pair domain-containing protein  34.74 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1038  transmembrane pair domain-containing protein  36.08 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0348543 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1959  transmembrane pair  39.18 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3200  transmembrane pair  44.58 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5167  transmembrane pair domain-containing protein  44.58 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5112  transmembrane pair domain-containing protein  44.58 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3488  transmembrane pair domain-containing protein  37.11 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1331  putative transmembrane protein  39.18 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2729  hypothetical protein  39.18 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1443  transmembrane pair domain-containing protein  39.18 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1406  membrane protein  41.18 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3587  hypothetical protein  42.17 
 
 		 169 aa  67.4  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26850  hypothetical protein  42.5 
 
 		 171 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4434  transmembrane pair domain-containing protein  37.93 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.521452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3410  transmembrane pair domain-containing protein  41.57 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3256  transmembrane pair domain protein  42.5 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2274  hypothetical protein  42.5 
 
 		 156 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3358  transmembrane pair  39.76 
 
 		 159 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0242065  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2213  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1304  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0698  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2532  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1143  hypothetical protein  39.76 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2082  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1151  hypothetical protein  39.76 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.171517  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0509  hypothetical protein  35.29 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0566  transmembrane pair  32.18 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3512  transmembrane pair domain protein  34.94 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4117  transmembrane pair domain protein  35.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4004  transmembrane pair domain protein  35.48 
 
 		 145 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0636  transmembrane pair domain protein  33.33 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0944  hypothetical protein  38.55 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244377  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0621  hypothetical protein  36.47 
 
 		 138 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2263  transmembrane pair domain-containing protein  34.94 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2416  transmembrane pair domain-containing protein  34.94 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2673  transmembrane pair domain-containing protein  35.96 
 
 		 144 aa  60.1  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2542  transmembrane pair domain-containing protein  38.55 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0217  transmembrane pair domain-containing protein  35.8 
 
 		 164 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0923  transmembrane pair domain-containing protein  34.94 
 
 		 148 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.147874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0138  transmembrane pair domain-containing protein  35.37 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0156  transmembrane pair domain protein  35.37 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0196  transmembrane pair domain-containing protein  34.52 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5695  hypothetical protein  34.94 
 
 		 148 aa  57  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0749  transmembrane pair  36.59 
 
 		 196 aa  57  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4322  transmembrane pair  37.18 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2711  transmembrane pair  39.53 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.033662  normal  0.02743 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0403  transmembrane pair  36.14 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3037  transmembrane pair domain-containing protein  32.18 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2274  transmembrane pair domain-containing protein  33.73 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1744  transmembrane pair  33.73 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2356  transmembrane pair domain-containing protein  33.73 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2377  transmembrane pair domain-containing protein  33.73 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2392  transmembrane pair domain-containing protein  32.53 
 
 		 145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0076  transmembrane pair domain protein  33.72 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  hitchhiker  0.00285306 
 
 
-
 
NC_003296  RS04790  hypothetical protein  35 
 
 		 145 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791947  normal  0.0241492 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4695  transmembrane pair domain-containing protein  35.44 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.262095 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2251  transmembrane pair domain protein  31.71 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389341  normal  0.485214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0301  transmembrane protein  35.8 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3795  transmembrane pair domain-containing protein  34.15 
 
 		 140 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1348  transmembrane pair domain-containing protein  38.27 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000078602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3019  transmembrane pair  31.58 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5347  transmembrane pair domain-containing protein  31.58 
 
 		 146 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0209953  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15630  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00366593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2930  transmembrane pair domain-containing protein  39.02 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.47404  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4923  transmembrane pair domain-containing protein  31.58 
 
 		 146 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4339  transmembrane pair  34.15 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3382  transmembrane pair domain-containing protein  35 
 
 		 146 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5226  transmembrane pair domain-containing protein  32.91 
 
 		 146 aa  50.4  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0303  transmembrane pair domain-containing protein  30.59 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2317  transmembrane pair domain-containing protein  39.02 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3487  transmembrane pair domain-containing protein  30.95 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125843  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2489  transmembrane pair domain-containing protein  39.02 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0063  transmembrane pair domain-containing protein  40 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>