113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0461 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0461  membrane protein  100 
 
 
169 aa  340  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3200  transmembrane pair  94.96 
 
 
141 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5167  transmembrane pair domain-containing protein  94.96 
 
 
141 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5112  transmembrane pair domain-containing protein  94.96 
 
 
141 aa  268  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2930  transmembrane pair domain-containing protein  55.4 
 
 
143 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.47404  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2317  transmembrane pair domain-containing protein  53.24 
 
 
143 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2489  transmembrane pair domain-containing protein  53.24 
 
 
143 aa  138  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588447  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3447  transmembrane pair domain protein  53.24 
 
 
143 aa  137  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0196  transmembrane pair domain-containing protein  46.85 
 
 
154 aa  136  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0138  transmembrane pair domain-containing protein  45.39 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0217  transmembrane pair domain-containing protein  41.13 
 
 
164 aa  128  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0170  transmembrane pair domain protein  48.91 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0156  transmembrane pair domain protein  45.39 
 
 
162 aa  127  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3487  transmembrane pair domain-containing protein  39.86 
 
 
142 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125843  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2251  transmembrane pair domain protein  39.13 
 
 
142 aa  124  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389341  normal  0.485214 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1725  transmembrane pair domain-containing protein  39.13 
 
 
142 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0403  transmembrane pair  42.36 
 
 
151 aa  122  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1882  transmembrane pair domain-containing protein  38.97 
 
 
142 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.285177  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4339  transmembrane pair  40.88 
 
 
146 aa  120  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1694  transmembrane pair domain-containing protein  46.48 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26850  hypothetical protein  43.41 
 
 
171 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2274  hypothetical protein  44.96 
 
 
156 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1348  transmembrane pair domain-containing protein  38.69 
 
 
145 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000078602  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4695  transmembrane pair domain-containing protein  40.88 
 
 
146 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.262095 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2480  hypothetical protein  37.96 
 
 
147 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2213  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1304  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0698  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2532  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1143  hypothetical protein  41.18 
 
 
153 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2082  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120286  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3358  transmembrane pair  42.31 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0242065  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28430  hypothetical protein  37.23 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318843 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0301  transmembrane protein  39.26 
 
 
149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1151  hypothetical protein  41.18 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.171517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3587  hypothetical protein  44.44 
 
 
169 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0923  transmembrane pair domain-containing protein  39.39 
 
 
148 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147874 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5226  transmembrane pair domain-containing protein  38.69 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0944  hypothetical protein  42.31 
 
 
151 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244377  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3019  transmembrane pair  39.42 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5347  transmembrane pair domain-containing protein  39.42 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0209953  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3382  transmembrane pair domain-containing protein  38.85 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4923  transmembrane pair domain-containing protein  38.85 
 
 
146 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2031  hypothetical protein  45.32 
 
 
148 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0739  hypothetical protein  45.32 
 
 
148 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0647  hypothetical protein  45.32 
 
 
148 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.13427  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4117  transmembrane pair domain protein  40.15 
 
 
145 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2274  transmembrane pair domain-containing protein  40.62 
 
 
148 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4004  transmembrane pair domain protein  40.15 
 
 
145 aa  108  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3190  transmembrane pair domain protein  42.64 
 
 
151 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3354  transmembrane pair domain-containing protein  42.64 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3253  transmembrane pair domain protein  42.64 
 
 
151 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0302797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3239  transmembrane pair domain-containing protein  42.64 
 
 
151 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.722595  hitchhiker  0.00127863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3173  transmembrane pair domain protein  42.64 
 
 
151 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2263  transmembrane pair domain-containing protein  41.6 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1937  hypothetical protein  42.96 
 
 
185 aa  106  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1744  transmembrane pair  39.84 
 
 
152 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2356  transmembrane pair domain-containing protein  39.84 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2377  transmembrane pair domain-containing protein  39.84 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2392  transmembrane pair domain-containing protein  39.06 
 
 
145 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0789  transmembrane pair domain protein  42.64 
 
 
177 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3512  transmembrane pair domain protein  40 
 
 
146 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5695  hypothetical protein  40.62 
 
 
148 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516693  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3488  transmembrane pair domain-containing protein  43.94 
 
 
155 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2711  transmembrane pair  40.94 
 
 
177 aa  102  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.033662  normal  0.02743 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0509  hypothetical protein  38.93 
 
 
153 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4322  transmembrane pair  40 
 
 
145 aa  101  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2416  transmembrane pair domain-containing protein  40 
 
 
142 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371458  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0749  transmembrane pair  36.03 
 
 
196 aa  100  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1025  transmembrane pair domain protein  41.6 
 
 
156 aa  100  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4292  transmembrane pair domain protein  37.23 
 
 
154 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2542  transmembrane pair domain-containing protein  41.73 
 
 
149 aa  99.8  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003832  hypothetical protein  40.48 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4434  transmembrane pair domain-containing protein  32.41 
 
 
146 aa  98.6  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.521452  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15630  predicted membrane protein  40.67 
 
 
179 aa  97.8  6e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00366593  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3037  transmembrane pair domain-containing protein  38.89 
 
 
147 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1826  transmembrane pair domain-containing protein  36.29 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1331  putative transmembrane protein  39.53 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2729  hypothetical protein  39.53 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1443  transmembrane pair domain-containing protein  39.53 
 
 
158 aa  97.1  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3301  transmembrane pair domain-containing protein  40.31 
 
 
152 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3256  transmembrane pair domain protein  35.71 
 
 
154 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1959  transmembrane pair  39.39 
 
 
146 aa  95.5  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_003296  RS04790  hypothetical protein  42.74 
 
 
145 aa  94.7  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791947  normal  0.0241492 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0566  transmembrane pair  38.35 
 
 
149 aa  94.4  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1184  transmembrane pair domain protein  42.06 
 
 
144 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3184  transmembrane pair domain-containing protein  42.06 
 
 
144 aa  93.6  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3328  transmembrane pair domain-containing protein  42.06 
 
 
144 aa  94  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1406  membrane protein  35.88 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0621  hypothetical protein  33.85 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5841  transmembrane pair domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  91.3  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000571539 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0422  hypothetical protein  36.8 
 
 
142 aa  90.9  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4391  transmembrane pair domain-containing protein  33.85 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.52144 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5096  transmembrane pair domain protein  36.57 
 
 
147 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01850  hypothetical protein  39.68 
 
 
140 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1038  transmembrane pair domain-containing protein  35.82 
 
 
147 aa  89  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0348543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1165  transmembrane pair domain protein  35.82 
 
 
147 aa  88.2  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3587  transmembrane pair domain-containing protein  33.81 
 
 
144 aa  87.8  6e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3410  transmembrane pair domain-containing protein  40.8 
 
 
150 aa  87.8  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0303  transmembrane pair domain-containing protein  29.66 
 
 
146 aa  87.4  9e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>