113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0403 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_0403  transmembrane pair  100 
 
 
151 aa  304  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2031  hypothetical protein  61.49 
 
 
148 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0739  hypothetical protein  61.49 
 
 
148 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0647  hypothetical protein  61.49 
 
 
148 aa  159  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.13427  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0217  transmembrane pair domain-containing protein  55.1 
 
 
164 aa  157  5e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0170  transmembrane pair domain protein  59.42 
 
 
153 aa  155  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3487  transmembrane pair domain-containing protein  53.9 
 
 
142 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125843  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2480  hypothetical protein  55.24 
 
 
147 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1725  transmembrane pair domain-containing protein  53.9 
 
 
142 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4339  transmembrane pair  53.62 
 
 
146 aa  154  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1882  transmembrane pair domain-containing protein  53.19 
 
 
142 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.285177  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2251  transmembrane pair domain protein  53.9 
 
 
142 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389341  normal  0.485214 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1348  transmembrane pair domain-containing protein  52.17 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000078602  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1937  hypothetical protein  60.42 
 
 
185 aa  153  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28430  hypothetical protein  55.07 
 
 
147 aa  153  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318843 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0196  transmembrane pair domain-containing protein  51.08 
 
 
154 aa  151  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1694  transmembrane pair domain-containing protein  55.63 
 
 
169 aa  150  4e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4923  transmembrane pair domain-containing protein  51.85 
 
 
146 aa  140  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3019  transmembrane pair  51.11 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5347  transmembrane pair domain-containing protein  51.11 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0209953  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0156  transmembrane pair domain protein  51.49 
 
 
162 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0301  transmembrane protein  47.95 
 
 
149 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0138  transmembrane pair domain-containing protein  50.75 
 
 
162 aa  136  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5226  transmembrane pair domain-containing protein  50.37 
 
 
146 aa  133  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4695  transmembrane pair domain-containing protein  49.63 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.262095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3382  transmembrane pair domain-containing protein  45.89 
 
 
146 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0461  membrane protein  42.36 
 
 
169 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3200  transmembrane pair  40.43 
 
 
141 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5167  transmembrane pair domain-containing protein  40.43 
 
 
141 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5112  transmembrane pair domain-containing protein  40.43 
 
 
141 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3447  transmembrane pair domain protein  50.36 
 
 
143 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0749  transmembrane pair  40.28 
 
 
196 aa  115  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4292  transmembrane pair domain protein  44.3 
 
 
154 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2317  transmembrane pair domain-containing protein  49.64 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2489  transmembrane pair domain-containing protein  49.64 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588447  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2930  transmembrane pair domain-containing protein  48.92 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.47404  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3587  hypothetical protein  42.31 
 
 
169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3587  transmembrane pair domain-containing protein  38.97 
 
 
144 aa  106  9.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0923  transmembrane pair domain-containing protein  43.75 
 
 
148 aa  106  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147874 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3358  transmembrane pair  42.97 
 
 
159 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0242065  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26850  hypothetical protein  39.47 
 
 
171 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2274  hypothetical protein  42.97 
 
 
156 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15630  predicted membrane protein  46.32 
 
 
179 aa  102  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00366593  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4117  transmembrane pair domain protein  41.48 
 
 
145 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4004  transmembrane pair domain protein  41.48 
 
 
145 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1406  membrane protein  34.81 
 
 
143 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2392  transmembrane pair domain-containing protein  40.62 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4434  transmembrane pair domain-containing protein  33.33 
 
 
146 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.521452  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2274  transmembrane pair domain-containing protein  39.84 
 
 
148 aa  98.2  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1744  transmembrane pair  39.06 
 
 
152 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2213  hypothetical protein  40.77 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1304  hypothetical protein  40.77 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2356  transmembrane pair domain-containing protein  39.06 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0698  hypothetical protein  40.77 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2532  hypothetical protein  40.77 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1143  hypothetical protein  40.77 
 
 
153 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2082  hypothetical protein  40.77 
 
 
151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120286  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2377  transmembrane pair domain-containing protein  39.06 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2542  transmembrane pair domain-containing protein  47.52 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5695  hypothetical protein  39.06 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516693  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1151  hypothetical protein  40 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.171517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0944  hypothetical protein  40.77 
 
 
151 aa  94  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3488  transmembrane pair domain-containing protein  39.84 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0303  transmembrane pair domain-containing protein  34.51 
 
 
146 aa  93.6  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04790  hypothetical protein  46.27 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791947  normal  0.0241492 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2711  transmembrane pair  36.92 
 
 
177 aa  92.8  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.033662  normal  0.02743 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5841  transmembrane pair domain-containing protein  38.41 
 
 
147 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000571539 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5096  transmembrane pair domain protein  37.23 
 
 
147 aa  90.5  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1959  transmembrane pair  36.73 
 
 
146 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1165  transmembrane pair domain protein  39.42 
 
 
147 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0621  hypothetical protein  31.88 
 
 
138 aa  88.2  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4391  transmembrane pair domain-containing protein  31.62 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.52144 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3037  transmembrane pair domain-containing protein  39.68 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3512  transmembrane pair domain protein  37.1 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1038  transmembrane pair domain-containing protein  37.23 
 
 
147 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0348543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2263  transmembrane pair domain-containing protein  37.1 
 
 
146 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003832  hypothetical protein  30.61 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0509  hypothetical protein  30.92 
 
 
153 aa  83.6  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4322  transmembrane pair  36.15 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1025  transmembrane pair domain protein  34.88 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0076  transmembrane pair domain protein  34.48 
 
 
146 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.746235  hitchhiker  0.00285306 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0789  transmembrane pair domain protein  34.88 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3338  transmembrane pair domain-containing protein  31.01 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2416  transmembrane pair domain-containing protein  37.9 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371458  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0422  hypothetical protein  33.85 
 
 
142 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3743  hypothetical protein  33.6 
 
 
150 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0566  transmembrane pair  35.97 
 
 
149 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1150  transmembrane pair domain-containing protein  32.26 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0722868 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0063  transmembrane pair domain-containing protein  39.32 
 
 
147 aa  77.4  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01850  hypothetical protein  32.28 
 
 
140 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0636  transmembrane pair domain protein  34.25 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3256  transmembrane pair domain protein  35.71 
 
 
154 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3190  transmembrane pair domain protein  35.66 
 
 
151 aa  76.3  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1343  transmembrane pair domain-containing protein  33.85 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00249061  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3253  transmembrane pair domain protein  35.66 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0302797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3239  transmembrane pair domain-containing protein  35.66 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.722595  hitchhiker  0.00127863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3173  transmembrane pair domain protein  35.66 
 
 
151 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3354  transmembrane pair domain-containing protein  35.66 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1331  putative transmembrane protein  28.77 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2729  hypothetical protein  28.77 
 
 
158 aa  73.2  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>