113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0749 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0749  transmembrane pair  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.266324 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0196  transmembrane pair domain-containing protein  46.92 
 
 
154 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0138  transmembrane pair domain-containing protein  47.79 
 
 
162 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0156  transmembrane pair domain protein  46.32 
 
 
162 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0217  transmembrane pair domain-containing protein  44.44 
 
 
164 aa  124  9e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28430  hypothetical protein  45.45 
 
 
147 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2480  hypothetical protein  41.84 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4923  transmembrane pair domain-containing protein  44.6 
 
 
146 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15630  predicted membrane protein  42.96 
 
 
179 aa  119  3e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00366593  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3019  transmembrane pair  43.88 
 
 
146 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5347  transmembrane pair domain-containing protein  43.88 
 
 
146 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0209953  normal  0.410913 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4695  transmembrane pair domain-containing protein  44.7 
 
 
146 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.262095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1694  transmembrane pair domain-containing protein  45.83 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4339  transmembrane pair  41.67 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5226  transmembrane pair domain-containing protein  43.94 
 
 
146 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0403  transmembrane pair  40.28 
 
 
151 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0170  transmembrane pair domain protein  42.75 
 
 
153 aa  115  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1348  transmembrane pair domain-containing protein  44.7 
 
 
145 aa  115  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000078602  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3382  transmembrane pair domain-containing protein  43.94 
 
 
146 aa  115  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0301  transmembrane protein  43.94 
 
 
149 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1937  hypothetical protein  48.91 
 
 
185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1882  transmembrane pair domain-containing protein  39.85 
 
 
142 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.285177  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2031  hypothetical protein  47.14 
 
 
148 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.595461  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0739  hypothetical protein  47.14 
 
 
148 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.624879  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0647  hypothetical protein  47.14 
 
 
148 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.13427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3487  transmembrane pair domain-containing protein  40.91 
 
 
142 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125843  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1725  transmembrane pair domain-containing protein  39.26 
 
 
142 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2251  transmembrane pair domain protein  40.15 
 
 
142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.389341  normal  0.485214 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0461  membrane protein  36.03 
 
 
169 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.406706 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3200  transmembrane pair  35.51 
 
 
141 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5167  transmembrane pair domain-containing protein  35.51 
 
 
141 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.120702  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5112  transmembrane pair domain-containing protein  35.51 
 
 
141 aa  99  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0923  transmembrane pair domain-containing protein  40.15 
 
 
148 aa  94.4  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.147874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2930  transmembrane pair domain-containing protein  41.61 
 
 
143 aa  94.4  9e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.47404  normal  0.248627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2317  transmembrane pair domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2489  transmembrane pair domain-containing protein  42.34 
 
 
143 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00588447  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3447  transmembrane pair domain protein  42.34 
 
 
143 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4117  transmembrane pair domain protein  39.2 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4004  transmembrane pair domain protein  39.2 
 
 
145 aa  93.2  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.502959  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2213  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1304  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0698  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2532  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1143  hypothetical protein  38.28 
 
 
153 aa  90.5  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2082  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120286  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4292  transmembrane pair domain protein  36.36 
 
 
154 aa  90.5  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.657806 
 
 
-
 
NC_003296  RS04790  hypothetical protein  38.71 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791947  normal  0.0241492 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1151  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.171517  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0944  hypothetical protein  38.28 
 
 
151 aa  89.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.244377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26850  hypothetical protein  36.51 
 
 
171 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2274  transmembrane pair domain-containing protein  37.5 
 
 
148 aa  88.6  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2274  hypothetical protein  36.51 
 
 
156 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316534  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2392  transmembrane pair domain-containing protein  35.94 
 
 
145 aa  85.5  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2377  transmembrane pair domain-containing protein  35.94 
 
 
148 aa  84.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2356  transmembrane pair domain-containing protein  35.94 
 
 
148 aa  84.7  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1744  transmembrane pair  35.94 
 
 
152 aa  84.3  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.808651  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2673  transmembrane pair domain-containing protein  34.31 
 
 
144 aa  84  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5695  hypothetical protein  35.94 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.516693  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3358  transmembrane pair  35.16 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0242065  normal  0.398562 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2711  transmembrane pair  37.98 
 
 
177 aa  81.3  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.033662  normal  0.02743 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3587  hypothetical protein  35.16 
 
 
169 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003832  hypothetical protein  32.28 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0789  transmembrane pair domain protein  35.57 
 
 
177 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.149154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1165  transmembrane pair domain protein  32.58 
 
 
147 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.229668  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01850  hypothetical protein  32.28 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0636  transmembrane pair domain protein  29.94 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1025  transmembrane pair domain protein  33.56 
 
 
156 aa  78.6  0.00000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1343  transmembrane pair domain-containing protein  34.62 
 
 
136 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00249061  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3587  transmembrane pair domain-containing protein  34.07 
 
 
144 aa  77  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5096  transmembrane pair domain protein  30.71 
 
 
147 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5841  transmembrane pair domain-containing protein  30.77 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000571539 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4322  transmembrane pair  32.81 
 
 
145 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1826  transmembrane pair domain-containing protein  32.8 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.239684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0422  hypothetical protein  34.92 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1038  transmembrane pair domain-containing protein  30.3 
 
 
147 aa  73.9  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0348543 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0621  hypothetical protein  30.83 
 
 
138 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2542  transmembrane pair domain-containing protein  33.58 
 
 
149 aa  73.6  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.4668 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3184  transmembrane pair domain-containing protein  35.2 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1184  transmembrane pair domain protein  35.2 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3328  transmembrane pair domain-containing protein  35.2 
 
 
144 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3037  transmembrane pair domain-containing protein  30.95 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2263  transmembrane pair domain-containing protein  29.6 
 
 
146 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3512  transmembrane pair domain protein  29.6 
 
 
146 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.118178  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1150  transmembrane pair domain-containing protein  31.45 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0722868 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3743  hypothetical protein  32 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1331  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3256  transmembrane pair domain protein  32.8 
 
 
154 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0010771  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2729  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1443  transmembrane pair domain-containing protein  33.33 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4434  transmembrane pair domain-containing protein  30 
 
 
146 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.521452  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2416  transmembrane pair domain-containing protein  29.6 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371458  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3488  transmembrane pair domain-containing protein  30.16 
 
 
155 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3410  transmembrane pair domain-containing protein  39.37 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1959  transmembrane pair  30.46 
 
 
146 aa  68.2  0.00000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.147892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1243  hypothetical protein  33.6 
 
 
136 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.548617 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3354  transmembrane pair domain-containing protein  32.82 
 
 
151 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4391  transmembrane pair domain-containing protein  28.57 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.52144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1406  membrane protein  30.47 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0509  hypothetical protein  31.3 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285417  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3301  transmembrane pair domain-containing protein  31.54 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>