186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0812 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0812  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 136 aa  280  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3817  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 335 aa  249  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.890047 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3635  extracellular solute-binding protein family 1  99.16 
 
 		 335 aa  247  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.84257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3693  extracellular solute-binding protein  98.32 
 
 		 335 aa  245  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0002551  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0744  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  86.55 
 
 		 335 aa  222  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3517  extracellular solute-binding protein  88.24 
 
 		 335 aa  222  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3347  extracellular solute-binding protein  88.24 
 
 		 335 aa  222  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0606  extracellular solute-binding protein  87.39 
 
 		 335 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3227  extracellular solute-binding protein  88.24 
 
 		 335 aa  215  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0636  extracellular solute-binding protein  65.55 
 
 		 335 aa  166  8e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.632135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0996  extracellular solute-binding protein  66.39 
 
 		 335 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000369263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0666  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  65.87 
 
 		 335 aa  159  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0053906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  63.03 
 
 		 335 aa  157  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0861  extracellular solute-binding protein  63.87 
 
 		 335 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  59.66 
 
 		 335 aa  152  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1012  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  61.76 
 
 		 335 aa  136  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676586  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3007  ABC iron(III) transporter periplasmic binding protein  52.54 
 
 		 339 aa  135  1e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.050744  normal  0.546259 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0137  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  53.78 
 
 		 352 aa  135  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000186976  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1092  extracellular solute-binding protein  59.8 
 
 		 337 aa  133  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000221625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2588  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein  57.84 
 
 		 337 aa  131  3e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03435  hypothetical protein  50.86 
 
 		 337 aa  127  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002574  ferric iron ABC transporter iron-binding protein  50.86 
 
 		 337 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000722094  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0783  periplasmic iron-binding protein  51.89 
 
 		 338 aa  121  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.27536  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0769  extracellular solute-binding protein  48.28 
 
 		 347 aa  116  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.302389  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2913  ABC Fe+3 siderophore transporter, periplasmic substrate-binding protein  51.52 
 
 		 336 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1557  extracellular solute-binding protein  51.52 
 
 		 336 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.456805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  42.86 
 
 		 349 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1108  extracellular solute-binding protein  48.48 
 
 		 336 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.122481  normal  0.048242 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  44.07 
 
 		 346 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6369  extracellular solute-binding protein family 1  44.44 
 
 		 345 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290821  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0700  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  48.21 
 
 		 338 aa  107  5e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5861  extracellular solute-binding protein  43.65 
 
 		 345 aa  107  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0655  putative iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  48.21 
 
 		 380 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4447  extracellular solute-binding protein  48.96 
 
 		 337 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.181234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3699  extracellular solute-binding protein family 1  48.45 
 
 		 354 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2989  extracellular solute-binding protein family 1  46.53 
 
 		 348 aa  102  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1346  extracellular solute-binding protein family 1  43.48 
 
 		 349 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0473337  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6288  extracellular solute-binding protein  40.17 
 
 		 341 aa  100  9e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3824  extracellular solute-binding protein  45.54 
 
 		 338 aa  100  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3764  extracellular solute-binding protein  45.63 
 
 		 362 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2093  extracellular solute-binding protein  44 
 
 		 347 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412416  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0579  extracellular solute-binding protein family 1  43.75 
 
 		 341 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0570  extracellular solute-binding protein  43.75 
 
 		 341 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1439  extracellular solute-binding protein  41.18 
 
 		 337 aa  98.2  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0543  extracellular solute-binding protein family 1  40.48 
 
 		 341 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0688  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  44.33 
 
 		 351 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0464  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  44.33 
 
 		 351 aa  97.1  8e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224989  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1777  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  44.33 
 
 		 351 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1511  ABC transporter, substrate binding protein  44.33 
 
 		 351 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  46.23 
 
 		 345 aa  96.7  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1182  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  44.33 
 
 		 351 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1378  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  44.33 
 
 		 351 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.215691  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1382  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  44.33 
 
 		 351 aa  96.7  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.560702  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4318  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  43.3 
 
 		 347 aa  95.9  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.434511  normal  0.628753 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2856  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-compound-binding protein, putative  44.33 
 
 		 347 aa  96.3  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.143151  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1183  extracellular solute-binding protein  43 
 
 		 347 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0923795  normal  0.478437 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  42.74 
 
 		 335 aa  95.5  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  41.67 
 
 		 374 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4631  extracellular solute-binding protein family 1  39.22 
 
 		 336 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.464324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3947  extracellular solute-binding protein  38.83 
 
 		 338 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000383863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  41.67 
 
 		 374 aa  93.6  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0730  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 347 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1093  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 347 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.762259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1210  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 347 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13233  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1463  extracellular solute-binding protein  40.2 
 
 		 338 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.46603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1093  extracellular solute-binding protein  42.27 
 
 		 347 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.39155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  44.44 
 
 		 339 aa  89.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  45.36 
 
 		 345 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  38.78 
 
 		 349 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0179  extracellular solute-binding protein  43.93 
 
 		 341 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.405977  normal  0.1363 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  39.64 
 
 		 351 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12551  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  36.84 
 
 		 342 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.733876  hitchhiker  0.00360834 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  38.24 
 
 		 337 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0774  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  30.71 
 
 		 341 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  36.36 
 
 		 340 aa  75.5  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20451  hypothetical protein  36.67 
 
 		 342 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.41005 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16181  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  31.71 
 
 		 341 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13611  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  34.38 
 
 		 340 aa  75.1  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2002  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  38.78 
 
 		 332 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0211  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  42.27 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  39.58 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  36 
 
 		 355 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0792  extracellular solute-binding protein family 1  39.18 
 
 		 348 aa  72  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.775597 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1578  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  34.48 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.49279  normal  0.0225547 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  38.79 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0189  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.24 
 
 		 334 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13521  ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  33.86 
 
 		 323 aa  72.4  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0168  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  41.24 
 
 		 334 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1261  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  33.82 
 
 		 343 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  39.6 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  36.08 
 
 		 333 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1200  extracellular solute-binding protein  36.28 
 
 		 337 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  34.21 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  37.86 
 
 		 366 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  35.35 
 
 		 334 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13311  putative iron ABC transporter, substrate binding protein  30.37 
 
 		 340 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.327656  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  36.27 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2587  extracellular solute-binding protein family 1  40.62 
 
 		 337 aa  68.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.390541  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  36.27 
 
 		 332 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>