33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3609 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  100 
 
 
173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  92.09 
 
 
177 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  50.71 
 
 
147 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  55.86 
 
 
169 aa  135  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  44.3 
 
 
165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  42.86 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  41.72 
 
 
169 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  43.17 
 
 
171 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  51.75 
 
 
118 aa  121  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  51.72 
 
 
118 aa  120  9e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  49.15 
 
 
118 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  48.28 
 
 
116 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  44.54 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  39.87 
 
 
212 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  45.61 
 
 
156 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  48.96 
 
 
124 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  39.81 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  36.09 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  35.92 
 
 
184 aa  67.8  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  33.33 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  30.19 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  31.93 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  28.07 
 
 
169 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  27.5 
 
 
156 aa  53.9  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  30.47 
 
 
184 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  36.79 
 
 
113 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3400  hypothetical protein  61.11 
 
 
60 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  32.69 
 
 
179 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  35.64 
 
 
170 aa  48.9  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  29.57 
 
 
136 aa  44.3  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0356  hypothetical protein  29.27 
 
 
118 aa  42.4  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18140  hypothetical protein  31.47 
 
 
195 aa  41.2  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>