28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4852 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  319  9.000000000000001e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  47.06 
 
 
147 aa  111  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  44.92 
 
 
177 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  41.8 
 
 
169 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  45.22 
 
 
165 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  45.61 
 
 
173 aa  100  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  39.37 
 
 
177 aa  99.8  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  39.88 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  38.26 
 
 
116 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  46.67 
 
 
118 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  48.98 
 
 
171 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  42.48 
 
 
118 aa  94  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  45.1 
 
 
212 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  40.94 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  50.6 
 
 
124 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  35.9 
 
 
142 aa  84  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  43.16 
 
 
118 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  38.06 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  39.81 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  38.98 
 
 
155 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  36 
 
 
167 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  36.11 
 
 
327 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  37.27 
 
 
184 aa  58.5  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  35.19 
 
 
154 aa  53.9  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  33.66 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  41.94 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  34.48 
 
 
170 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>