30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6829 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  331  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  49.62 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  37.29 
 
 
147 aa  81.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  30 
 
 
169 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  38.6 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  38.74 
 
 
118 aa  73.9  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  31.52 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  34.78 
 
 
118 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  36 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  28.4 
 
 
177 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  31.48 
 
 
212 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  32.52 
 
 
167 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  33.6 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  31.15 
 
 
177 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  31.62 
 
 
118 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  32.43 
 
 
171 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  31.93 
 
 
173 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  31.82 
 
 
169 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  31.73 
 
 
116 aa  62  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  26.76 
 
 
184 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  27.52 
 
 
184 aa  52.4  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  22.36 
 
 
154 aa  51.6  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  49.7  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  25.49 
 
 
142 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  29.13 
 
 
156 aa  48.1  0.00005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  31.37 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  35.82 
 
 
170 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0412  hypothetical protein  28.57 
 
 
114 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1586  hypothetical protein  30 
 
 
123 aa  41.6  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000521302  normal  0.608079 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  24.77 
 
 
327 aa  41.2  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>