27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0721 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0037  hypothetical protein  62.71 
 
 		 172 aa  128  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  58.49 
 
 		 113 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  50.34 
 
 		 179 aa  127  8.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  53.7 
 
 		 184 aa  119  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  49.57 
 
 		 154 aa  114  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  43.27 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2875  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  34.48 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  40.96 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18140  hypothetical protein  29.09 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.540484  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  37.8 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  43.08 
 
 		 136 aa  50.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  36.21 
 
 		 177 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  31.06 
 
 		 165 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  38.04 
 
 		 173 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  35.19 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  30.61 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1722  hypothetical protein  32.26 
 
 		 117 aa  47.4  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  29.75 
 
 		 171 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  37.84 
 
 		 118 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  35.14 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  35.8 
 
 		 118 aa  43.9  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  34.48 
 
 		 156 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  32.93 
 
 		 167 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  29.81 
 
 		 177 aa  40.8  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>