31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0630 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  239  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  67.57 
 
 		 165 aa  160  7e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  59.83 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  55.56 
 
 		 169 aa  136  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  54.39 
 
 		 171 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  57.55 
 
 		 212 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  57.94 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  51.75 
 
 		 167 aa  124  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  49.57 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  52.14 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  51.3 
 
 		 118 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  49.15 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  50.43 
 
 		 177 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  49.57 
 
 		 177 aa  116  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  46.61 
 
 		 142 aa  113  7.999999999999999e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  46.73 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  46.67 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  36.21 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  37.86 
 
 		 197 aa  74.3  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  37.72 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  34.29 
 
 		 327 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  37.07 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  31.96 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0441  hypothetical protein  36.36 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3167  hypothetical protein  36.11 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1944  hypothetical protein  40.79 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.634335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0721  hypothetical protein  35.8 
 
 		 170 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.209049 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3400  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2181  hypothetical protein  30.61 
 
 		 184 aa  44.7  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.251956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.348334 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4454  hypothetical protein  27.35 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0120363  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>