25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_20340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_20340  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  358  2e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.356712  normal  0.338631 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2714  hypothetical protein  64.06 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0718  hypothetical protein  43.14 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3353  hypothetical protein  41.54 
 
 		 147 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3798  hypothetical protein  32.31 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000273897 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35580  hypothetical protein  44.33 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100322  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1581  hypothetical protein  42.05 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.191154  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0630  hypothetical protein  36.21 
 
 		 118 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2513  hypothetical protein  37.08 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.115847  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2710  hypothetical protein  38.3 
 
 		 118 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4852  hypothetical protein  39.81 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0936889  normal  0.227122 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1696  hypothetical protein  36.89 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1138  hypothetical protein  32.37 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.384612 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8331  hypothetical protein  37.07 
 
 		 169 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3609  conserved hypothetical protein-like protein  35.65 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3792  hypothetical protein  32.41 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.488318  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3050  hypothetical protein  44.78 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0634  hypothetical protein  32.33 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.717092  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2282  hypothetical protein  36.27 
 
 		 155 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.808357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001031  hypothetical protein  31.03 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0765  hypothetical protein  37.18 
 
 		 327 aa  58.5  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000109433 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6829  hypothetical protein  36.36 
 
 		 167 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3142  hypothetical protein  35.94 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000133898  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3689  hypothetical protein  54 
 
 		 258 aa  42  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0309  extracellular solute-binding protein family 5  38.98 
 
 		 765 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>